22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2847 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2847  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  413  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1592  hypothetical protein  57.36 
 
 
198 aa  224  8e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1983  hypothetical protein  52.79 
 
 
198 aa  213  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.428764  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2757  hypothetical protein  54.92 
 
 
200 aa  213  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.088945  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1959  hypothetical protein  51.53 
 
 
207 aa  211  7.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95171  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2929  hypothetical protein  51.55 
 
 
208 aa  211  9e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0666  hypothetical protein  50.5 
 
 
205 aa  209  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.494626 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0646  hypothetical protein  50.5 
 
 
205 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5292  hypothetical protein  46.15 
 
 
206 aa  187  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4574  hypothetical protein  40.8 
 
 
201 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493342  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2967  hypothetical protein  52.67 
 
 
151 aa  159  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.586657  normal  0.086374 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3292  hypothetical protein  49.38 
 
 
164 aa  145  3e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.948121  decreased coverage  0.00586872 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0805  hypothetical protein  42.86 
 
 
99 aa  84  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4422  hypothetical protein  30.54 
 
 
212 aa  77.8  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2919  hypothetical protein  29.41 
 
 
202 aa  77  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.246564 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1342  hypothetical protein  30.56 
 
 
203 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1907  hypothetical protein  28 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000033227 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3023  hypothetical protein  45.45 
 
 
67 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0220  hypothetical protein  26.01 
 
 
204 aa  62.4  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0149567  hitchhiker  0.00492185 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1789  hypothetical protein  55.32 
 
 
66 aa  58.9  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0819  hypothetical protein  23.5 
 
 
205 aa  56.6  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.743694  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4453  hypothetical protein  25.32 
 
 
203 aa  54.3  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.133427  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>