13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1682 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1682  hypothetical protein  100 
 
 
400 aa  837    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.604554  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1681  hypothetical protein  47.88 
 
 
405 aa  410  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113675  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1680  hypothetical protein  42.54 
 
 
409 aa  347  3e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1679  hypothetical protein  41.94 
 
 
407 aa  342  9e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.552873 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1677  hypothetical protein  39.75 
 
 
417 aa  332  1e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2281  lipolytic protein G-D-S-L family  38.54 
 
 
397 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2332  lipolytic protein G-D-S-L family  38.79 
 
 
397 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1675  hypothetical protein  24.54 
 
 
355 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1672  hypothetical protein  30.19 
 
 
405 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1079  GDSL family lipase  27.53 
 
 
362 aa  47  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.415771  normal  0.165061 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2460  hypothetical protein  26.92 
 
 
370 aa  47  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0105  hypothetical protein  28.68 
 
 
402 aa  47  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.397439  normal  0.982214 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0126  GDSL family lipase  28.28 
 
 
393 aa  43.5  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    unclonable  0.00000000000000550004 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>