13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1488 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1488  hypothetical protein  100 
 
 		 446 aa  915    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1917  hypothetical protein  34.75 
 
 		 297 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2984  hypothetical protein  32.33 
 
 		 263 aa  144  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1481  sulfotransferase  42.42 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3516  hypothetical protein  28.5 
 
 		 276 aa  93.2  9e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0791811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1487  hypothetical protein  26.91 
 
 		 612 aa  87  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3235  tetratricopeptide TPR_2  40.19 
 
 		 734 aa  76.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1401  hypothetical protein  46.67 
 
 		 81 aa  71.2  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1402  hypothetical protein  43.18 
 
 		 88 aa  67.8  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.877066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6933  hypothetical protein  29.29 
 
 		 522 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.291527  normal  0.0470724 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1455  response regulator receiver protein  25.99 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.766573  normal  0.626047 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1485  hypothetical protein  27.19 
 
 		 392 aa  50.8  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0609062 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 		 1486 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>