21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0705 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_0705  GTP cyclohydrolase II domain-containing protein  100 
 
 		 79 aa  163  9e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3257  hypothetical protein  55.84 
 
 		 412 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.394015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0313  hypothetical protein  57.89 
 
 		 425 aa  87.4  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0467  hypothetical protein  55.41 
 
 		 418 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.0053089  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2000  hypothetical protein  55.41 
 
 		 418 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.307496  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2663  hypothetical protein  56 
 
 		 450 aa  85.1  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2974  hypothetical protein  56.76 
 
 		 423 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.575279  normal  0.632902 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2194  hypothetical protein  49.35 
 
 		 422 aa  83.2  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2166  hypothetical protein  49.35 
 
 		 422 aa  83.2  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5190  hypothetical protein  53.33 
 
 		 426 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.150921  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5279  hypothetical protein  53.33 
 
 		 426 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5571  hypothetical protein  53.33 
 
 		 426 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2104  hypothetical protein  52.94 
 
 		 418 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2716  hypothetical protein  51.95 
 
 		 417 aa  82.4  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.390419  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4219  hypothetical protein  54.55 
 
 		 420 aa  81.3  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1965  hypothetical protein  54.67 
 
 		 451 aa  80.9  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3985  hypothetical protein  48.05 
 
 		 412 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.096593  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10981  GTP cyclohydrolase II, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01220)  46.58 
 
 		 446 aa  75.5  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.831279  normal  0.375541 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4572  hypothetical protein  46.67 
 
 		 412 aa  73.9  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.540224  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_006682  CNM00180  cyclohydrolase, putative  46.67 
 
 		 562 aa  72  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0672332  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42619  predicted protein  51.52 
 
 		 494 aa  69.7  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.122745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>