14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2426 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2426  hypothetical protein  100 
 
 
67 aa  137  3e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673876  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1701  hypothetical protein  83.05 
 
 
66 aa  108  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4011  hypothetical protein  79.66 
 
 
63 aa  103  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00919056  normal  0.126113 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3737  hypothetical protein  75 
 
 
64 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.449152  normal  0.0661797 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1475  hypothetical protein  71.67 
 
 
62 aa  97.4  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.667972  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2514  hypothetical protein  71.43 
 
 
66 aa  93.6  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0253188  hitchhiker  0.00675709 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2376  hypothetical protein  69.84 
 
 
66 aa  93.2  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0649259  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4709  hypothetical protein  69.64 
 
 
79 aa  89.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143834  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4776  hypothetical protein  68.25 
 
 
77 aa  90.1  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0259432  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4640  hypothetical protein  67.86 
 
 
86 aa  88.2  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.606174  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1857  hypothetical protein  62.3 
 
 
119 aa  87.8  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0534563  decreased coverage  0.00174056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3001  hypothetical protein  64.06 
 
 
64 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884927  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3060  hypothetical protein  55.38 
 
 
128 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.135721  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4209  hypothetical protein  64.29 
 
 
85 aa  82.4  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>