14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2514 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2514  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  138  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0253188  hitchhiker  0.00675709 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2376  hypothetical protein  96.97 
 
 
66 aa  137  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0649259  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4209  hypothetical protein  68.85 
 
 
85 aa  98.2  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4640  hypothetical protein  72.41 
 
 
86 aa  98.6  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.606174  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3737  hypothetical protein  75.44 
 
 
64 aa  98.6  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.449152  normal  0.0661797 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4011  hypothetical protein  73.68 
 
 
63 aa  94.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00919056  normal  0.126113 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1701  hypothetical protein  75.44 
 
 
66 aa  94  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2426  hypothetical protein  71.43 
 
 
67 aa  93.6  9e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673876  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1475  hypothetical protein  68.42 
 
 
62 aa  90.9  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.667972  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4709  hypothetical protein  67.86 
 
 
79 aa  90.5  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143834  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4776  hypothetical protein  67.86 
 
 
77 aa  89  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0259432  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3001  hypothetical protein  63.49 
 
 
64 aa  87.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884927  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1857  hypothetical protein  62.5 
 
 
119 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0534563  decreased coverage  0.00174056 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3060  hypothetical protein  58.46 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.135721  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>