14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3001 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3001  hypothetical protein  100 
 
 
64 aa  132  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884927  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4709  hypothetical protein  75.44 
 
 
79 aa  92  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143834  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3737  hypothetical protein  73.68 
 
 
64 aa  90.5  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.449152  normal  0.0661797 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4640  hypothetical protein  69.64 
 
 
86 aa  88.2  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.606174  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2376  hypothetical protein  62.9 
 
 
66 aa  87.4  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0649259  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2514  hypothetical protein  63.49 
 
 
66 aa  87.4  6e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0253188  hitchhiker  0.00675709 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1701  hypothetical protein  70.18 
 
 
66 aa  87.4  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2426  hypothetical protein  64.06 
 
 
67 aa  86.3  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673876  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4011  hypothetical protein  69.49 
 
 
63 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00919056  normal  0.126113 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4209  hypothetical protein  61.29 
 
 
85 aa  84.3  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4776  hypothetical protein  62.5 
 
 
77 aa  82  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0259432  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1475  hypothetical protein  64.91 
 
 
62 aa  82  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.667972  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1857  hypothetical protein  55.17 
 
 
119 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0534563  decreased coverage  0.00174056 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3060  hypothetical protein  56.9 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.135721  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>