14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3060 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3060  hypothetical protein  100 
 
 		 128 aa  249  8.000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.135721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1857  hypothetical protein  62.9 
 
 		 119 aa  138  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0534563  decreased coverage  0.00174056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2426  hypothetical protein  55.38 
 
 		 67 aa  82.8  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000673876  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4709  hypothetical protein  57.35 
 
 		 79 aa  82.8  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0143834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4011  hypothetical protein  62.07 
 
 		 63 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00919056  normal  0.126113 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1701  hypothetical protein  66.07 
 
 		 66 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2376  hypothetical protein  60 
 
 		 66 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0649259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2514  hypothetical protein  58.46 
 
 		 66 aa  78.2  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0253188  hitchhiker  0.00675709 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3737  hypothetical protein  58.93 
 
 		 64 aa  77.8  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.449152  normal  0.0661797 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1475  hypothetical protein  60.71 
 
 		 62 aa  77  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.667972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4776  hypothetical protein  53.45 
 
 		 77 aa  73.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0259432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4640  hypothetical protein  52.63 
 
 		 86 aa  72.4  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.606174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3001  hypothetical protein  56.9 
 
 		 64 aa  70.5  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.884927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4209  hypothetical protein  50.88 
 
 		 85 aa  67  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>