84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1259 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_1259  septum formation initiator  100 
 
 
111 aa  221  3e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1187  cell division protein FtsB  38.64 
 
 
99 aa  60.1  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0200308  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1117  cell division protein FtsB  38.64 
 
 
99 aa  60.1  0.000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3135  septum formation initiator  38.64 
 
 
118 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.066535  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3126  septum formation initiator  38.64 
 
 
118 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.161431  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3278  septum formation initiator  38.64 
 
 
118 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115977  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1116  cell division protein FtsB  38.64 
 
 
99 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0372931  normal  0.865304 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1238  Septum formation initiator  38.64 
 
 
118 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00877838  hitchhiker  0.0000000000624401 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3439  hypothetical protein  38.64 
 
 
99 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2756  septum formation initiator  38.64 
 
 
118 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.451685  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1186  septum formation initiator  33.67 
 
 
98 aa  57.4  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1185  Septum formation initiator  38.3 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50143  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2106  cell division protein FtsB  34.55 
 
 
141 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5971  cell division protein FtsB  34.55 
 
 
141 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2124  cell division protein FtsB  34.55 
 
 
141 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.199661  normal  0.0187974 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0850  septum formation initiator family protein  38.1 
 
 
155 aa  53.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2143  cell division protein FtsB  34.29 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5412  cell division protein FtsB  33.64 
 
 
141 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2016  cell division protein FtsB  34.29 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275363 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2016  hypothetical protein  31.46 
 
 
89 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2021  hypothetical protein  31.46 
 
 
89 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2516  septum formation initiator family protein  39.19 
 
 
122 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1206  septum formation initiator  32.61 
 
 
100 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000148323  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1465  cell division protein FtsB  33.67 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2630  cell division protein FtsB  33.67 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1291  septum formation initiator  35.23 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000132598 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3126  cell division protein FtsB  33.67 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.679359  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2192  cell division protein FtsB  33.67 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0728748  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0976  Septum formation initiator  38.1 
 
 
111 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0407513 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2576  cell division protein FtsB  33.67 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1895  cell division protein FtsB  33.67 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2710  cell division protein FtsB  33.67 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1688  cell division protein FtsB  33.67 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000947762  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0665  Septum formation initiator  40 
 
 
138 aa  51.2  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1246  cell division protein FtsB  33.71 
 
 
100 aa  50.8  0.000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0420044  normal  0.710891 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0622  cell division protein FtsB  34.57 
 
 
114 aa  50.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3856  septum formation initiator  31.82 
 
 
92 aa  50.1  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0137964  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1037  cell division protein FtsB  34.25 
 
 
105 aa  50.4  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.850187 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0853  septum formation initiator  40 
 
 
91 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1469  Septum formation initiator  37.5 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0569  cell division protein FtsB  36.9 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0617  cell division protein FtsB  36.9 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.740532  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2363  cell division protein FtsB  34.83 
 
 
94 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.685194 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17330  hypothetical protein  30.95 
 
 
94 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1505  hypothetical protein  30.95 
 
 
94 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1453  cell division protein FtsB  35.14 
 
 
117 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00170  cell division protein FtsB  34.52 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.164971  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1056  cell division protein FtsB  39.19 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2639  cell division protein FtsB  40.28 
 
 
121 aa  48.1  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0671  septum formation initiator  27.17 
 
 
92 aa  47.4  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0137843  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1838  cell division protein FtsB  35.29 
 
 
95 aa  47  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0739072  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3349  septum formation initiator  44.9 
 
 
99 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000140943  hitchhiker  0.00000175822 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1814  septum formation initiator family protein  24.04 
 
 
111 aa  46.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.487608  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1053  septum formation initiator  35.62 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.217673  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1069  cell division protein FtsB  34.57 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0318895  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0973  cell division protein FtsB  34.57 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.108373  normal  0.0382578 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1092  cell division protein FtsB  36.49 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1663  septum formation initiator  30.97 
 
 
117 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000362225  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4062  septum formation initiator  31.17 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179344 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1130  cell division protein FtsB  34.57 
 
 
111 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3032  cell division protein FtsB  31.52 
 
 
108 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.528115  hitchhiker  0.0020798 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2513  cell division protein FtsB homolog  30 
 
 
94 aa  45.1  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.77414  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1438  cell division protein FtsB  37.33 
 
 
149 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0719593  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2285  Septum formation initiator  28.89 
 
 
128 aa  44.7  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.213854  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0922  septum formation initiator  34.83 
 
 
90 aa  44.3  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1938  Septum formation initiator  28.89 
 
 
133 aa  44.3  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1864  cell division protein ftsB  32.43 
 
 
89 aa  44.7  0.0005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0328  cell division protein  32.43 
 
 
89 aa  44.7  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2559  cell division protein FtsB  32.67 
 
 
145 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238531  normal  0.205599 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1164  cell division protein FtsB  34.74 
 
 
141 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116932 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1574  cell division protein FtsB  32.67 
 
 
143 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0501126  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1071  septum formation initiator family protein  34.52 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3185  cell division protein FtsB  30.23 
 
 
91 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.389841  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3447  Septum formation initiator  37.5 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1908  cell division protein FtsB  30 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.46013  normal  0.669467 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03720  septum formation initiator family protein  31.51 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00519538  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0741  septum formation initiator  27.96 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.83679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1436  septum formation initiator  52.5 
 
 
90 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.122119  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1869  septum formation initiator  36.56 
 
 
102 aa  41.6  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000425121  hitchhiker  0.0036544 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3511  cell division protein FtsB  40.68 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002509  cell division protein FtsB  26.97 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000404071  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1197  septum formation initiator  41.46 
 
 
74 aa  40.4  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00450437  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3354  cell division protein FtsB  42 
 
 
111 aa  40.4  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03524  cell division protein FtsB  25.56 
 
 
93 aa  40  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>