71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1938 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1938  Septum formation initiator  100 
 
 
133 aa  267  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2285  Septum formation initiator  97.22 
 
 
128 aa  193  7e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.213854  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2306  septum formation initiator  69.23 
 
 
96 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00775321  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1432  cell division protein FtsB  56.6 
 
 
110 aa  130  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.10917  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1814  septum formation initiator family protein  54.24 
 
 
111 aa  129  9e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.487608  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1021  septum formation initiator  56.99 
 
 
98 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0360067  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1139  Septum formation initiator  46.74 
 
 
99 aa  94.4  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.173764  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0741  septum formation initiator  35.87 
 
 
118 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.83679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0407  Septum formation initiator  35.05 
 
 
109 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0615837 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2072  cell division protein FtsB  33.33 
 
 
108 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00925626  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1895  cell division protein FtsB  29.2 
 
 
143 aa  57  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1194  Septum formation initiator  36.84 
 
 
100 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.031534  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2576  cell division protein FtsB  30.09 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2710  cell division protein FtsB  30.09 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2630  cell division protein FtsB  30.09 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1465  cell division protein FtsB  30.09 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3126  cell division protein FtsB  30.09 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.679359  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2192  cell division protein FtsB  30.09 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0728748  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1688  cell division protein FtsB  30.09 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000947762  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5412  cell division protein FtsB  30.08 
 
 
141 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3731  cell division protein FtsB  33.33 
 
 
126 aa  53.9  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  normal  0.931217 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0850  septum formation initiator family protein  34.48 
 
 
155 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0976  Septum formation initiator  34.48 
 
 
111 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0407513 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2124  cell division protein FtsB  30 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.199661  normal  0.0187974 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5971  cell division protein FtsB  30 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2106  cell division protein FtsB  30 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2064  Septum formation initiator  33.33 
 
 
110 aa  51.6  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2016  cell division protein FtsB  28.18 
 
 
141 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275363 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2143  cell division protein FtsB  28.18 
 
 
141 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1318  septum formation initiator  39.51 
 
 
109 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.114634  hitchhiker  0.00404126 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1186  septum formation initiator  30.21 
 
 
98 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1164  cell division protein FtsB  32.26 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116932 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1438  cell division protein FtsB  30.34 
 
 
149 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0719593  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1041  Septum formation initiator  26.21 
 
 
130 aa  47.4  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0224  Septum formation initiator  33.71 
 
 
122 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109543  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1259  septum formation initiator  26.8 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1913  Septum formation initiator  34.67 
 
 
102 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.537495  normal  0.573773 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0121  septum formation initiator  28.12 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1752  cell division protein FtsB  29.63 
 
 
121 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.483632  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0401  septum formation initiator  28.09 
 
 
132 aa  44.3  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1663  septum formation initiator  26.13 
 
 
117 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000362225  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0318  Septum formation initiator  36.92 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2639  cell division protein FtsB  29.29 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1908  cell division protein FtsB  29.59 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.46013  normal  0.669467 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1117  cell division protein FtsB  28.42 
 
 
99 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2016  hypothetical protein  26.19 
 
 
89 aa  41.6  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1187  cell division protein FtsB  28.42 
 
 
99 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0200308  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2021  hypothetical protein  26.19 
 
 
89 aa  41.6  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1069  cell division protein FtsB  30.14 
 
 
124 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0318895  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3135  septum formation initiator  29.47 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.066535  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3126  septum formation initiator  29.47 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.161431  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3278  septum formation initiator  29.47 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115977  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0973  cell division protein FtsB  30.14 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.108373  normal  0.0382578 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2798  putative cell division protein FtsL  27.71 
 
 
106 aa  41.2  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000066737  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1238  Septum formation initiator  29.47 
 
 
118 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00877838  hitchhiker  0.0000000000624401 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2364  septum formation initiator  25.3 
 
 
122 aa  40.8  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000636681  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1116  cell division protein FtsB  28.42 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0372931  normal  0.865304 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2484  cell division protein FtsL, putative  27.5 
 
 
130 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000770087  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1864  cell division protein ftsB  29.58 
 
 
89 aa  40.8  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1056  cell division protein FtsB  32.88 
 
 
113 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0328  cell division protein  29.58 
 
 
89 aa  40.8  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1092  cell division protein FtsB  32.88 
 
 
113 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2651  septum formation initiator  28.09 
 
 
99 aa  40.4  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0940  Septum formation initiator  30.95 
 
 
103 aa  40.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2886  cell division protein FtsB  30.95 
 
 
103 aa  40.4  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02598  cell diviision protein FtsB  30.95 
 
 
103 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02563  hypothetical protein  30.95 
 
 
103 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3999  cell division protein FtsB  30.95 
 
 
103 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2873  cell division protein FtsB  30.95 
 
 
103 aa  40.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.736595 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0964  cell division protein FtsB  30.95 
 
 
103 aa  40.4  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.429891  normal  0.487396 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3049  cell division protein FtsB  30.95 
 
 
103 aa  40.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.180273  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>