19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1318 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1318  septum formation initiator  100 
 
 
109 aa  215  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.114634  hitchhiker  0.00404126 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0407  Septum formation initiator  61.47 
 
 
109 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0615837 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2072  cell division protein FtsB  46.67 
 
 
108 aa  97.8  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00925626  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1194  Septum formation initiator  54.12 
 
 
100 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.031534  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1913  Septum formation initiator  34.15 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.537495  normal  0.573773 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0741  septum formation initiator  35.29 
 
 
118 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.83679e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2285  Septum formation initiator  38.78 
 
 
128 aa  53.5  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.213854  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1752  cell division protein FtsB  26.6 
 
 
121 aa  52.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.483632  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1938  Septum formation initiator  38.78 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1021  septum formation initiator  34.38 
 
 
98 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0360067  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1814  septum formation initiator family protein  38.14 
 
 
111 aa  51.6  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.487608  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1432  cell division protein FtsB  34.21 
 
 
110 aa  51.2  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.10917  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1139  Septum formation initiator  32.05 
 
 
99 aa  45.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.173764  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2306  septum formation initiator  29.11 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00775321  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2241  septum formation initiator  39.13 
 
 
101 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.300252 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3731  cell division protein FtsB  34.29 
 
 
126 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.969828  normal  0.931217 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2326  septum formation initiator  29.55 
 
 
105 aa  43.5  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3189  septum formation initiator  33.72 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.976039  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0310  Septum formation initiator  32.95 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000000820228  decreased coverage  0.0000968931 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>