127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3447 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_3447  Septum formation initiator  100 
 
 
92 aa  181  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3185  cell division protein FtsB  59.34 
 
 
91 aa  104  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.389841  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2651  septum formation initiator  58.24 
 
 
99 aa  99.8  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1321  cell division protein FtsB  61.64 
 
 
92 aa  95.1  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1182  septum formation initiator  56.96 
 
 
80 aa  92  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.539274  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5109  septum formation initiator  64.71 
 
 
92 aa  87.4  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.771169 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1688  cell division protein FtsB  50.62 
 
 
143 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000947762  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2710  cell division protein FtsB  50.62 
 
 
143 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1895  cell division protein FtsB  51.85 
 
 
143 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2192  cell division protein FtsB  50.62 
 
 
143 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0728748  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3126  cell division protein FtsB  50.62 
 
 
143 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.679359  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2576  cell division protein FtsB  50.62 
 
 
143 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2630  cell division protein FtsB  50.62 
 
 
143 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1465  cell division protein FtsB  50.62 
 
 
143 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0911  Septum formation initiator  61.54 
 
 
94 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.628816  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0996  cell division protein FtsB  61.54 
 
 
94 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2016  cell division protein FtsB  48.15 
 
 
141 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275363 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2143  cell division protein FtsB  48.15 
 
 
141 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5971  cell division protein FtsB  49.38 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2106  cell division protein FtsB  49.38 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2124  cell division protein FtsB  49.38 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.199661  normal  0.0187974 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5412  cell division protein FtsB  48.78 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3856  septum formation initiator  41.18 
 
 
92 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0137964  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3032  cell division protein FtsB  45.65 
 
 
108 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.528115  hitchhiker  0.0020798 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17330  hypothetical protein  46.15 
 
 
94 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1505  hypothetical protein  46.15 
 
 
94 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1291  septum formation initiator  47.56 
 
 
99 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000132598 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3439  hypothetical protein  47.56 
 
 
99 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1908  cell division protein FtsB  47.56 
 
 
106 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.46013  normal  0.669467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1187  cell division protein FtsB  47.56 
 
 
99 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0200308  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1117  cell division protein FtsB  47.56 
 
 
99 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1186  septum formation initiator  46.34 
 
 
98 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1238  Septum formation initiator  47.56 
 
 
118 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00877838  hitchhiker  0.0000000000624401 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1116  cell division protein FtsB  47.56 
 
 
99 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0372931  normal  0.865304 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3126  septum formation initiator  47.56 
 
 
118 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.161431  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3135  septum formation initiator  47.56 
 
 
118 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.066535  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3278  septum formation initiator  47.56 
 
 
118 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.115977  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1185  Septum formation initiator  50 
 
 
95 aa  71.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50143  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1206  septum formation initiator  45.12 
 
 
100 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000148323  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2649  septum formation initiator  59.34 
 
 
92 aa  70.5  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.303714  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2848  cell division protein FtsB  54.93 
 
 
91 aa  70.5  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.460691  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2756  septum formation initiator  46.34 
 
 
118 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.451685  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1246  cell division protein FtsB  41.18 
 
 
100 aa  69.7  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0420044  normal  0.710891 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002509  cell division protein FtsB  37.65 
 
 
93 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000404071  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1173  septum formation initiator  46.48 
 
 
94 aa  69.7  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.41848 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1071  septum formation initiator family protein  45.83 
 
 
99 aa  68.6  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1122  cell division protein FtsB  47.95 
 
 
92 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0997636  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03524  cell division protein FtsB  39.02 
 
 
93 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1167  septum formation initiator  48.61 
 
 
93 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.660298 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1438  cell division protein FtsB  52.05 
 
 
149 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0719593  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1613  septum formation initiator  48.61 
 
 
93 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137208  normal  0.913792 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1574  cell division protein FtsB  50.62 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0501126  normal  0.441206 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4164  septum formation initiator  48.61 
 
 
93 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.719866  normal  0.489861 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1164  cell division protein FtsB  50 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116932 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1364  septum formation initiator  51.39 
 
 
118 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2559  cell division protein FtsB  51.25 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238531  normal  0.205599 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0665  Septum formation initiator  46.58 
 
 
138 aa  67  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1555  hypothetical protein  51.39 
 
 
92 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.735707  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1869  septum formation initiator  41.3 
 
 
102 aa  67  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000425121  hitchhiker  0.0036544 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0835  cell division protein FtsB  45.21 
 
 
117 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1663  septum formation initiator  39.76 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000362225  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3349  septum formation initiator  47.22 
 
 
99 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000000140943  hitchhiker  0.00000175822 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3126  cell division protein FtsB  41.67 
 
 
103 aa  66.2  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0866  cell division protein FtsB  43.84 
 
 
115 aa  66.2  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3082  cell division protein FtsB  40.28 
 
 
103 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3241  cell division protein FtsB  40.28 
 
 
103 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1495  cell division protein FtsB  37.5 
 
 
93 aa  65.5  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03720  septum formation initiator family protein  45.78 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00519538  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3056  cell division protein FtsB  40.28 
 
 
103 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3219  cell division protein FtsB  40.28 
 
 
103 aa  65.5  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.263587 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3121  cell division protein FtsB  40.28 
 
 
103 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3137  cell division protein FtsB  40.28 
 
 
103 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.523276  normal  0.0827002 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02598  cell diviision protein FtsB  40.28 
 
 
103 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0940  Septum formation initiator  40.28 
 
 
103 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2021  hypothetical protein  40.96 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2016  hypothetical protein  40.96 
 
 
89 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2363  cell division protein FtsB  43.9 
 
 
94 aa  65.1  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.685194 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02563  hypothetical protein  40.28 
 
 
103 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1053  septum formation initiator  45.83 
 
 
100 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.217673  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3999  cell division protein FtsB  40.28 
 
 
103 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2886  cell division protein FtsB  40.28 
 
 
103 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3049  cell division protein FtsB  40.28 
 
 
103 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.180273  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0964  cell division protein FtsB  40.28 
 
 
103 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.429891  normal  0.487396 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2873  cell division protein FtsB  40.28 
 
 
103 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.736595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4062  septum formation initiator  47.22 
 
 
93 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179344 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3300  cell division protein FtsB  40.28 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0825  cell division protein FtsB  41.67 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.299697 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0965  cell division protein FtsB  40.28 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3432  cell division protein FtsB  40.28 
 
 
106 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.908703  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3354  cell division protein FtsB  41.67 
 
 
111 aa  64.3  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0671  septum formation initiator  39.02 
 
 
92 aa  63.9  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0137843  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1037  cell division protein FtsB  40.28 
 
 
105 aa  62.8  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.850187 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0948  septum formation initiator  38.75 
 
 
105 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00170  cell division protein FtsB  44.44 
 
 
121 aa  63.5  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.164971  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1229  septum formation initiator  44.59 
 
 
102 aa  62.4  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3511  cell division protein FtsB  41.67 
 
 
111 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38780  cell division protein-Septum formation initiator  45.21 
 
 
95 aa  62.4  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2639  cell division protein FtsB  44.44 
 
 
121 aa  62  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1664  Septum formation initiator  43.24 
 
 
90 aa  62  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1453  cell division protein FtsB  43.06 
 
 
117 aa  61.2  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>