13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2001 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2001  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  431  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2655  hypothetical protein  40.91 
 
 		 212 aa  105  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1356  hypothetical protein  35.2 
 
 		 201 aa  100  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0235226  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2987  hypothetical protein  31.72 
 
 		 193 aa  90.9  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000055381  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2679  hypothetical protein  34.78 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16910  hypothetical protein  37.36 
 
 		 169 aa  86.3  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8746  hypothetical protein  28.14 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8816  hypothetical protein  28.1 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3386  hypothetical protein  30.52 
 
 		 315 aa  57  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0391  hypothetical protein  31.53 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4092  hypothetical protein  32.32 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_6989  hypothetical protein  30.36 
 
 		 318 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21799  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2372  hypothetical protein  40.68 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>