12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0391 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0391  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  416  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2372  hypothetical protein  29.38 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4092  hypothetical protein  27.78 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16910  hypothetical protein  34.95 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1356  hypothetical protein  32.11 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0235226  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8746  hypothetical protein  35.14 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2001  hypothetical protein  31.53 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8816  hypothetical protein  33.65 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2987  hypothetical protein  38.57 
 
 		 193 aa  42.4  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000055381  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2679  hypothetical protein  26.92 
 
 		 190 aa  42  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3386  hypothetical protein  29.59 
 
 		 315 aa  41.6  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2655  hypothetical protein  33.66 
 
 		 212 aa  41.2  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>