172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6989 on replicon NC_010373
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010373  M446_6989  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  643    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.21799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8746  hypothetical protein  70.47 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8816  hypothetical protein  56.17 
 
 		 205 aa  169  5e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3386  hypothetical protein  51.52 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2655  hypothetical protein  36.55 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7194  transcriptional regulator, MucR family  86.84 
 
 		 145 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5073  transcriptional regulator, MucR family  73.47 
 
 		 139 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5626  transcriptional regulator, MucR family  86.11 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.63695  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2620  transcriptional regulator, MucR family  67.35 
 
 		 140 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.297322  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6298  MucR family transcriptional regulator  84.21 
 
 		 142 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0539112 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4087  transcriptional regulator, MucR family  84.21 
 
 		 141 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242362  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0608  MucR family transcriptional regulator  81.58 
 
 		 166 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0460505 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8754  transcriptional regulator, MucR family  78.05 
 
 		 143 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0065  MucR family transcriptional regulator  78.95 
 
 		 133 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.126654  normal  0.420331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4097  MucR family transcriptional regulator  81.58 
 
 		 143 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1006  MucR family transcriptional regulator  63.46 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4730  MucR family transcriptional regulator  76.32 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4944  MucR family transcriptional regulator  81.58 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6739  MucR family transcriptional regulator  78.05 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.055135 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2999  transcriptional regulator, MucR family  78.95 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2484  transcriptional regulator, MucR family  81.58 
 
 		 134 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281768  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0549  transcriptional regulator, MucR family  81.58 
 
 		 147 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973698  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3504  transcriptional regulator, MucR family  90.91 
 
 		 131 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3011  transcriptional regulator, MucR family  78.95 
 
 		 173 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8232  transcriptional regulator, MucR family  76.92 
 
 		 150 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7625  transcriptional regulator, MucR family  75.61 
 
 		 166 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1559  transcriptional regulator, MucR family  76.32 
 
 		 164 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.192096  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4660  transcriptional regulator, MucR family  81.58 
 
 		 139 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20016  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6579  transcriptional regulator, MucR family  75.61 
 
 		 166 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3559  transcriptional regulator, MucR family  67.35 
 
 		 144 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3346  MucR family transcriptional regulator  70.73 
 
 		 163 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4973  transcriptional regulator, MucR family  76.32 
 
 		 160 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3845  transcriptional regulator, MucR family  76.32 
 
 		 135 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4116  MucR family transcriptional regulator  76.32 
 
 		 140 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.147804 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2091  transcriptional regulator, MucR family  76.32 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2100  transcriptional regulator, MucR family  80.56 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4253  transcriptional regulator, MucR family  78.95 
 
 		 147 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0124  transcriptional regulator, MucR family  73.68 
 
 		 137 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.376819  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1890  MucR family transcriptional regulator  76.32 
 
 		 143 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6164  MucR family transcriptional regulator  59.57 
 
 		 174 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6742  MucR family transcriptional regulator  73.68 
 
 		 143 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3684  transcriptional regulator, MucR family  73.68 
 
 		 162 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3787  ROSMUCR transcriptional regulator  58.33 
 
 		 140 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0587  MucR family transcriptional regulator  73.68 
 
 		 157 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0109398  hitchhiker  0.00472777 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5488  MucR family transcriptional regulator  76.32 
 
 		 158 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.622801  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6603  MucR family transcriptional regulator  73.68 
 
 		 171 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.108608 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6899  MucR family transcriptional regulator  68.29 
 
 		 164 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7402  transcriptional regulator, MucR family  75 
 
 		 133 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169134  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6580  MucR family transcriptional regulator  75 
 
 		 133 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1808  transcriptional regulator, MucR family  73.68 
 
 		 160 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1517  MucR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.400145  normal  0.0460522 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8789  transcriptional regulator, MucR family  73.68 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.292559  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3386  MucR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0319872 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5563  MucR family transcriptional regulator  65.85 
 
 		 143 aa  62  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.550782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2474  transcriptional regulator, MucR family  50.91 
 
 		 168 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0725  MucR family transcriptional regulator  72.22 
 
 		 168 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.176548 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8284  transcriptional regulator, MucR family  67.57 
 
 		 143 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647815  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0075  MucR family transcriptional regulator  70.27 
 
 		 166 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1153  MucR family transcriptional regulator  59.52 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.877039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2468  transcriptional regulator, MucR family  50.94 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3505  transcriptional regulator, MucR family  40.86 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4669  MucR family transcriptional regulator  61.36 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0276  MucR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0114545 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3060  transcriptional regulator, MucR family  62.22 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2834  ROSMUCR transcriptional regulator  62.22 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2952  transcriptional regulator, MucR family  60 
 
 		 160 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8753  transcriptional regulator, MucR family  49.06 
 
 		 175 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286217  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7826  transcriptional regulator, MucR family  59.52 
 
 		 174 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0997  MucR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 170 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6541  transcriptional regulator, MucR family  65.79 
 
 		 144 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5932  MucR family transcriptional regulator  68.42 
 
 		 145 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5627  transcriptional regulator, MucR family  49.06 
 
 		 174 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.698408  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8109  transcriptional regulator, MucR family  48.94 
 
 		 173 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2438  ROSMUCR transcriptional regulator  64.86 
 
 		 143 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.634995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1341  MucR family transcriptional regulator  59.46 
 
 		 142 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4896  MucR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 180 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.127609  hitchhiker  0.00352911 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1029  MucR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 146 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1889  MucR family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5564  MucR family transcriptional regulator  59.46 
 
 		 156 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6439  MucR family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 151 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4938  transcriptional regulator, MucR family  59.46 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686756  normal  0.493177 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4988  transcriptional regulator, MucR family  62.16 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103901  normal  0.173335 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4474  ROSMUCR transcriptional regulator  59.46 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0068  transcriptional regulator, MucR family  54.76 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6743  MucR family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.328928  normal  0.300512 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4422  MucR family transcriptional regulator  61.9 
 
 		 145 aa  57  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.705801 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4977  transcriptional regulator, MucR family  64.86 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443589  normal  0.0364251 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1345  transcriptional regulator, MucR family  54.76 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000373643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3902  transcriptional regulator, MucR family  52.38 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6452  MucR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0082  transcriptional regulator, MucR family  50 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.288227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0536  transcriptional regulator, MucR family  62.16 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5190  MucR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 308 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.533774 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2842  MucR family transcriptional regulator  67.5 
 
 		 139 aa  55.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0170  ROSMUCR transcriptional regulator  50 
 
 		 186 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5483  transcriptional regulator, MucR family  57.14 
 
 		 147 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.596779  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1282  transcriptional regulator, MucR family  54.55 
 
 		 148 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.135766  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0871  MucR family transcriptional regulator  65 
 
 		 138 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4927  transcriptional regulator, MucR family  59.46 
 
 		 177 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.971725 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4463  ROSMUCR transcriptional regulator  59.46 
 
 		 177 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>