57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1782 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1782  hypothetical protein  100 
 
 
302 aa  625  1e-178  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0120  sulfotransferase  33.49 
 
 
281 aa  90.9  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520974  normal  0.327991 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1971  hypothetical protein  26.06 
 
 
324 aa  87.4  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.987274  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1095  sulfotransferase  29.47 
 
 
316 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0328  sulfotransferase  27.85 
 
 
303 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0638  sulfotransferase  26.96 
 
 
308 aa  75.1  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1419  sulfotransferase  23.08 
 
 
295 aa  72.8  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520974  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1494  sulfotransferase  25.99 
 
 
320 aa  72.4  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.750776  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1817  sulfotransferase domain protein  25.99 
 
 
320 aa  72.4  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4735  sulfotransferase  31.22 
 
 
273 aa  71.2  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1953  sulfotransferase  24.01 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.298171 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4099  sulfotransferase  38.18 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.215935 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0561  sulfotransferase  28.37 
 
 
275 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.693676 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  37.5 
 
 
887 aa  66.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0166  sulfotransferase  26.51 
 
 
295 aa  65.5  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000309117 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  28.71 
 
 
676 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0327  sulfotransferase  27.69 
 
 
309 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2863  sulfotransferase  28.02 
 
 
623 aa  62.8  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.211639  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3802  sulfotransferase  26.53 
 
 
279 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.370649 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0282  hypothetical protein  32.11 
 
 
289 aa  60.8  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.497354  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1380  sulfotransferase  25.31 
 
 
303 aa  60.1  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0376199  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4767  sulfotransferase  36.61 
 
 
682 aa  59.3  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.287127 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  22.93 
 
 
832 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  29.05 
 
 
681 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4005  sulfotransferase  28.43 
 
 
256 aa  58.2  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1180  sulfotransferase  25.89 
 
 
271 aa  57.4  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.572064  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3798  sulfotransferase  25.11 
 
 
306 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.274052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1946  sulfotransferase  25.5 
 
 
285 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.497008 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1766  sulfotransferase  25.57 
 
 
300 aa  57  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.805148  normal  0.0849812 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3100  sulfotransferase  29.41 
 
 
252 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4202  sulfotransferase  31.86 
 
 
288 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1765  sulfotransferase  23.43 
 
 
312 aa  53.9  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.968461  normal  0.0845328 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4200  sulfotransferase  33.05 
 
 
289 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.986754 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3864  sulfotransferase  32.43 
 
 
259 aa  52.4  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.752029  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4937  sulfotransferase  25.69 
 
 
311 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.202416  normal  0.410057 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0778  sulfotransferase  24.23 
 
 
302 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3846  putative deacetylase sulfotransferase  27.23 
 
 
260 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0891  sulfotransferase  25 
 
 
298 aa  50.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.229512  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2236  sulfotransferase  26.67 
 
 
327 aa  50.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410983  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5381  sulfotransferase  31.62 
 
 
281 aa  50.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4384  sulfotransferase  26.76 
 
 
316 aa  49.7  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.754558  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4736  sulfotransferase  27.54 
 
 
274 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3309  sulfotransferase  31.62 
 
 
253 aa  49.3  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.816579  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4033  putative deacetylase sulfotransferase  25.79 
 
 
328 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.180689  normal  0.0350502 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3772  sulfotransferase  25.25 
 
 
292 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16227  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4075  sulfotransferase  26.18 
 
 
260 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0470564  normal  0.231356 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0722  sulfotransferase  25.2 
 
 
235 aa  48.1  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0351676  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4203  sulfotransferase  28.7 
 
 
293 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2395  sulfotransferase  25 
 
 
311 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.009967  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3720  sulfotransferase  25.25 
 
 
292 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6521  sulfotransferase domain protein  22.37 
 
 
288 aa  46.6  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1837  sulfotransferase  25.85 
 
 
304 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.786413  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01341  hypothetical protein  31.13 
 
 
272 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1936  sulfotransferase  23.47 
 
 
295 aa  43.9  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.412049  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1358  sulfotransferase  30.97 
 
 
247 aa  43.9  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1012  sulfotransferase  24.36 
 
 
289 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3970  sulfotransferase  30.65 
 
 
293 aa  42.7  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0330664  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>