26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2208 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2208  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  337  5.9999999999999996e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.61991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2829  hypothetical protein  59.13 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.309089  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1466  hypothetical protein  58.26 
 
 		 119 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0121167  normal  0.991272 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2147  protein of unknown function DUF1636  53.45 
 
 		 118 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426113  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1516  hypothetical protein  56.03 
 
 		 119 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.214468  normal  0.0632804 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3113  hypothetical protein  53.57 
 
 		 133 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0155825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2435  hypothetical protein  49.57 
 
 		 118 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.819641  normal  0.169893 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2934  hypothetical protein  42.37 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0112187  hitchhiker  0.00298069 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1717  protein of unknown function DUF1636  46.46 
 
 		 154 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131158  hitchhiker  0.00708925 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1442  hypothetical protein  45.67 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.339439 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1439  protein of unknown function DUF1636  48.44 
 
 		 129 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.926113  normal  0.434429 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2530  hypothetical protein  51.72 
 
 		 117 aa  91.7  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1891  hypothetical protein  41.67 
 
 		 142 aa  87.8  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3288  hypothetical protein  45.45 
 
 		 156 aa  87  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0275499  normal  0.685943 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0784  protein of unknown function DUF1636  42.37 
 
 		 143 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0639  hypothetical protein  39.32 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3142  hypothetical protein  45.45 
 
 		 79 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.716998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0741  hypothetical protein  35.92 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.645608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0559  protein of unknown function DUF1636  33.33 
 
 		 135 aa  70.5  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0255  hypothetical protein  43.24 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000015466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1547  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2408  protein of unknown function DUF1636  33.85 
 
 		 134 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0160265  normal  0.924945 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0158  hypothetical protein  33.61 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0329  hypothetical protein  33.85 
 
 		 135 aa  57.4  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0227  hypothetical protein  35.37 
 
 		 129 aa  51.2  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0167  protein of unknown function DUF1636  28.81 
 
 		 127 aa  44.7  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.439841  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>