29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0559 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0559  protein of unknown function DUF1636  100 
 
 		 135 aa  278  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2208  hypothetical protein  33.33 
 
 		 167 aa  70.5  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.61991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1547  hypothetical protein  30.95 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0227  hypothetical protein  36.25 
 
 		 129 aa  67  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0787  hypothetical protein  34.19 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2443  hypothetical protein  34.19 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539754  decreased coverage  0.00328356 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0393  hypothetical protein  33.64 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.311408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3113  hypothetical protein  32.17 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0155825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0255  hypothetical protein  37.97 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000015466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2435  hypothetical protein  32.76 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.819641  normal  0.169893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3142  hypothetical protein  36.49 
 
 		 79 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.716998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0158  hypothetical protein  29.66 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2408  protein of unknown function DUF1636  29.41 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0160265  normal  0.924945 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2147  protein of unknown function DUF1636  30.97 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426113  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0168  hypothetical protein  32.99 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2221  hypothetical protein  38.16 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1717  protein of unknown function DUF1636  29.84 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131158  hitchhiker  0.00708925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0784  protein of unknown function DUF1636  26.55 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1439  protein of unknown function DUF1636  30.65 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.926113  normal  0.434429 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0639  hypothetical protein  28.32 
 
 		 195 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1442  hypothetical protein  29.84 
 
 		 152 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.339439 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3288  hypothetical protein  31.86 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0275499  normal  0.685943 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0741  hypothetical protein  36.84 
 
 		 180 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.645608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2829  hypothetical protein  29.66 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.309089  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1516  hypothetical protein  29.91 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.214468  normal  0.0632804 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1466  hypothetical protein  29.66 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0121167  normal  0.991272 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2934  hypothetical protein  29 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0112187  hitchhiker  0.00298069 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0167  protein of unknown function DUF1636  27.19 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.439841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2543  hypothetical protein  36.51 
 
 		 102 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.746046 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>