22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0329 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0329  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  279  8.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0167  protein of unknown function DUF1636  42.5 
 
 		 127 aa  90.1  9e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.439841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1466  hypothetical protein  38.14 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0121167  normal  0.991272 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2829  hypothetical protein  37.29 
 
 		 119 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.309089  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1516  hypothetical protein  38.14 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.214468  normal  0.0632804 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2435  hypothetical protein  37.7 
 
 		 118 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.819641  normal  0.169893 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2147  protein of unknown function DUF1636  34.17 
 
 		 118 aa  62  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.426113  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3113  hypothetical protein  35.29 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0155825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2208  hypothetical protein  33.85 
 
 		 167 aa  57.4  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.61991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1547  hypothetical protein  28.1 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2408  protein of unknown function DUF1636  26.23 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0160265  normal  0.924945 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0227  hypothetical protein  31.93 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1439  protein of unknown function DUF1636  28.24 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.926113  normal  0.434429 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0158  hypothetical protein  28.93 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0639  hypothetical protein  28.46 
 
 		 195 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1717  protein of unknown function DUF1636  25.76 
 
 		 154 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131158  hitchhiker  0.00708925 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0255  hypothetical protein  29.73 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000015466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1442  hypothetical protein  25.38 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.339439 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2934  hypothetical protein  29.84 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0112187  hitchhiker  0.00298069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1891  hypothetical protein  29.41 
 
 		 142 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.432746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3142  hypothetical protein  33.33 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.716998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0784  protein of unknown function DUF1636  27.73 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>