51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1710 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1710  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  517  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3514  hypothetical protein  44.31 
 
 		 265 aa  195  6e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0771701  hitchhiker  0.000812749 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1135  hypothetical protein  38.64 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.384251 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5594  hypothetical protein  37.5 
 
 		 266 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2829  putative ABC phosphate/phosphonate transporter, periplasmic ligand binding protein  39.55 
 
 		 271 aa  124  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.539872 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4690  putative ABC phosphate/phosphonate transporter, periplasmic ligand binding protein  36.73 
 
 		 263 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0964  putative ABC phosphate/phosphonate transporter, periplasmic ligand binding protein  35.1 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.323615 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6539  hypothetical protein  35.71 
 
 		 287 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.222284 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2351  putative ABC phosphate/phosphonate transporter, periplasmic ligand binding protein  39.41 
 
 		 266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4346  hypothetical protein  35.25 
 
 		 263 aa  115  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67370  hypothetical protein  34.69 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3558  putative ABC phosphate/phosphonate transporter, periplasmic ligand binding protein  34.41 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.862715 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1449  hypothetical protein  36.27 
 
 		 259 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.827987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5834  hypothetical protein  36.55 
 
 		 340 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4995  ABC phosphate/phosphonate transporter, periplasmic ligand binding protein  35.02 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5865  ABC phosphate/phosphonate transporter, periplasmic ligand binding protein  35.02 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2974  ABC phosphate/phosphonate transporter, periplasmic ligand binding protein  33.33 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5097  ABC phosphate/phosphonate transporter, periplasmic ligand binding protein  34.52 
 
 		 274 aa  98.6  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.650822  normal  0.0466663 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4314  ABC phosphate/phosphonate transporter, periplasmic ligand binding protein  32.94 
 
 		 275 aa  91.7  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979772  hitchhiker  0.0000139647 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5241  ABC phosphate/phosphonate transporter, periplasmic ligand binding protein  35.68 
 
 		 274 aa  88.6  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3248  ABC phosphate/phosphonate transporter, periplasmic ligand binding protein  34.63 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.237018 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0219  hypothetical protein  34.25 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2395  hypothetical protein  30.65 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0956  hypothetical protein  32.43 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1243  hypothetical protein  32.43 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2218  hypothetical protein  32.43 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1664  hypothetical protein  32.43 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1939  hypothetical protein  32.54 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0207  hypothetical protein  32.54 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0297  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, periplasmic component  32.54 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3249  phosphonate ABC transporter, periplasmic phosphonate-binding protein  33.81 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5014  ABC-type phosphate/phosphonate transport system periplasmic component-like  29.82 
 
 		 266 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00105685  normal  0.163334 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1352  ABC-type phosphate/phosphonate transport system periplasmic component-like protein  27.78 
 
 		 267 aa  54.7  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000484922 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1192  phosphonate ABC transporter, periplasmic phosphonate-binding protein  23.01 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000205362  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1232  phosphonate ABC transporter, periplasmic phosphonate-binding protein  30.82 
 
 		 321 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0384  phosphonate ABC transporter, periplasmic phosphonate-binding protein  27.45 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2746  phosphonate ABC transporter, periplasmic phosphonate-binding protein  28.03 
 
 		 308 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0218  phosphonate ABC transporter, periplasmic phosphonate-binding protein  27.55 
 
 		 299 aa  47.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.2002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2858  ABC-type phosphate/phosphonate transport system periplasmic component-like protein  27.93 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.926328  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1487  phosphonate ABC transporter, periplasmic phosphonate-binding protein  26.67 
 
 		 308 aa  46.6  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.28358  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0350  phosphonate ABC transporter, periplasmic phosphonate-binding protein  27.81 
 
 		 285 aa  45.8  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2300  phosphonate-binding periplasmic protein  24.84 
 
 		 290 aa  45.8  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.749292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3095  phosphonate-binding periplasmic protein  28.92 
 
 		 284 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259959  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3946  phosphate/phosphonate ABC transporter  28.26 
 
 		 291 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4961  phosphonate ABC transporter periplasmic phosphonate-binding protein  28.89 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3197  phosphonate ABC transporter, periplasmic phosphonate-binding protein  26.28 
 
 		 283 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0129713 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2975  ABC-type phosphate/phosphonate transport system periplasmic component-like  25.38 
 
 		 270 aa  43.5  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2602  phosphonate-binding periplasmic protein  27.74 
 
 		 292 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3670  phosphonate ABC transporter, periplasmic phosphonate-binding protein  27.36 
 
 		 307 aa  42.7  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4993  phosphonate ABC transporter, periplasmic phosphonate-binding protein  25.88 
 
 		 305 aa  42.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1806  hypothetical protein  24.42 
 
 		 285 aa  42  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>