44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5097 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5097  ABC phosphate/phosphonate transporter, periplasmic ligand binding protein  100 
 
 		 274 aa  546  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.650822  normal  0.0466663 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3248  ABC phosphate/phosphonate transporter, periplasmic ligand binding protein  95.26 
 
 		 274 aa  500  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.237018 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2974  ABC phosphate/phosphonate transporter, periplasmic ligand binding protein  80.29 
 
 		 274 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5865  ABC phosphate/phosphonate transporter, periplasmic ligand binding protein  79.56 
 
 		 275 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.808754 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4995  ABC phosphate/phosphonate transporter, periplasmic ligand binding protein  79.56 
 
 		 275 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5241  ABC phosphate/phosphonate transporter, periplasmic ligand binding protein  78.47 
 
 		 274 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4314  ABC phosphate/phosphonate transporter, periplasmic ligand binding protein  79.93 
 
 		 275 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979772  hitchhiker  0.0000139647 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1243  hypothetical protein  73.38 
 
 		 278 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1664  hypothetical protein  73.38 
 
 		 278 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0956  hypothetical protein  73.38 
 
 		 278 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0219  hypothetical protein  73.74 
 
 		 278 aa  370  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2218  hypothetical protein  73.38 
 
 		 278 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1939  hypothetical protein  73.23 
 
 		 269 aa  354  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0207  hypothetical protein  73.23 
 
 		 269 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0297  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, periplasmic component  73.23 
 
 		 269 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4690  putative ABC phosphate/phosphonate transporter, periplasmic ligand binding protein  55.72 
 
 		 263 aa  277  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0964  putative ABC phosphate/phosphonate transporter, periplasmic ligand binding protein  55.35 
 
 		 263 aa  268  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.323615 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3558  putative ABC phosphate/phosphonate transporter, periplasmic ligand binding protein  55.56 
 
 		 262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.862715 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2829  putative ABC phosphate/phosphonate transporter, periplasmic ligand binding protein  40.94 
 
 		 271 aa  161  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.539872 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6539  hypothetical protein  44.24 
 
 		 287 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.222284 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1449  hypothetical protein  38.75 
 
 		 259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.827987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5594  hypothetical protein  48.5 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67370  hypothetical protein  38.16 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5834  hypothetical protein  36.28 
 
 		 340 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2351  putative ABC phosphate/phosphonate transporter, periplasmic ligand binding protein  35.79 
 
 		 266 aa  125  7e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4346  hypothetical protein  35.78 
 
 		 263 aa  123  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3514  hypothetical protein  36.95 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0771701  hitchhiker  0.000812749 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1710  hypothetical protein  35.27 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2395  hypothetical protein  34.68 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1162  ABC-type phosphate/phosphonate transport system periplasmic component-like  31.82 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.304187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1135  hypothetical protein  32.44 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.384251 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5014  ABC-type phosphate/phosphonate transport system periplasmic component-like  30.07 
 
 		 266 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00105685  normal  0.163334 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1352  ABC-type phosphate/phosphonate transport system periplasmic component-like protein  26.11 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000484922 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5201  hypothetical protein  28.32 
 
 		 278 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.739918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2602  phosphonate-binding periplasmic protein  26.1 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3249  phosphonate ABC transporter, periplasmic phosphonate-binding protein  29.46 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3946  phosphate/phosphonate ABC transporter  28.26 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2975  ABC-type phosphate/phosphonate transport system periplasmic component-like  26.14 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2858  ABC-type phosphate/phosphonate transport system periplasmic component-like protein  24.11 
 
 		 260 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.926328  normal  0.812783 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1487  phosphonate ABC transporter, periplasmic phosphonate-binding protein  25.11 
 
 		 308 aa  48.9  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.28358  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2746  phosphonate ABC transporter, periplasmic phosphonate-binding protein  24.22 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0384  phosphonate ABC transporter, periplasmic phosphonate-binding protein  25.9 
 
 		 300 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4304  phosphonate-binding periplasmic protein  28.57 
 
 		 348 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000531117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1232  phosphonate ABC transporter, periplasmic phosphonate-binding protein  24.39 
 
 		 321 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>