14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0810 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0810  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  267  4e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.640809  hitchhiker  0.000556523 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2412  hypothetical protein  55.42 
 
 		 224 aa  92  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.144102  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2080  conserved hypothetical protein, internal deletion  39.82 
 
 		 126 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0036018  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3411  hypothetical protein  46.43 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  unclonable  1.18281e-16 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3372  hypothetical protein  37.1 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2785  hypothetical protein  46.43 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.128294 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3245  hypothetical protein  48.05 
 
 		 189 aa  72  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000619696  hitchhiker  0.0000000118682 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2197  hypothetical protein  36.26 
 
 		 194 aa  60.5  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3554  hypothetical protein  34.02 
 
 		 129 aa  47.8  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.034542  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3543  hypothetical protein  32.37 
 
 		 182 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3707  hypothetical protein  32.2 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1224  hypothetical protein  29.13 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6235  hypothetical protein  26.43 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7010  hypothetical protein  26.95 
 
 		 147 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>