12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0781 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0781  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  212  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0127046 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0820  hypothetical protein  54.69 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.158787  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00499  predicted protein  54.69 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.359553  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00504  hypothetical protein  54.69 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.305111  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1608  hypothetical protein  53.12 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000452633 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3223  hypothetical protein  53.12 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.419981  hitchhiker  0.00257122 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2234  hypothetical protein  52.31 
 
 		 97 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0299  hypothetical protein  42.17 
 
 		 96 aa  67  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1553  hypothetical protein  49.23 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000304739 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4128  hypothetical protein  49.23 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.625129 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3891  hypothetical protein  47.69 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000262818 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2229  protein of unknown function DUF1364  52.46 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>