13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1553 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1553  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  202  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000304739 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4128  hypothetical protein  94.85 
 
 		 98 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.625129 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3891  hypothetical protein  88.66 
 
 		 98 aa  184  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000262818 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0299  hypothetical protein  68.13 
 
 		 96 aa  131  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2234  hypothetical protein  61.86 
 
 		 97 aa  122  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00499  predicted protein  61.54 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.359553  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0820  hypothetical protein  60.44 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.158787  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00504  hypothetical protein  61.54 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.305111  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1608  hypothetical protein  59.34 
 
 		 96 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000452633 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3223  hypothetical protein  60.44 
 
 		 96 aa  110  9e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.419981  hitchhiker  0.00257122 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0781  hypothetical protein  49.23 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0127046 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2229  protein of unknown function DUF1364  50.82 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2465  hypothetical protein  40 
 
 		 164 aa  41.2  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>