12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2229 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2229  protein of unknown function DUF1364  100 
 
 		 87 aa  185  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0820  hypothetical protein  50 
 
 		 96 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.158787  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4128  hypothetical protein  41.18 
 
 		 98 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.625129 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00499  predicted protein  50 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.359553  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3891  hypothetical protein  40.91 
 
 		 98 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000262818 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00504  hypothetical protein  50 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.305111  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2234  hypothetical protein  46.97 
 
 		 97 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1608  hypothetical protein  48.44 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000452633 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1553  hypothetical protein  50.82 
 
 		 98 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000304739 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0299  hypothetical protein  50 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3223  hypothetical protein  48.44 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.419981  hitchhiker  0.00257122 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0781  hypothetical protein  52.46 
 
 		 101 aa  61.6  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0127046 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>