20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1495 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1495  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  350  5.9999999999999994e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0555  hypothetical protein  42.5 
 
 
173 aa  117  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0628452  normal  0.0529731 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1853  hypothetical protein  34.91 
 
 
173 aa  112  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.540609  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3944  hypothetical protein  36.71 
 
 
173 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2556  hypothetical protein  41.22 
 
 
183 aa  104  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4399  hypothetical protein  34.62 
 
 
170 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000658631 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4336  hypothetical protein  35.9 
 
 
170 aa  99  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4301  hypothetical protein  34.38 
 
 
178 aa  98.6  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.159041  normal  0.191419 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04981  hypothetical protein  32.45 
 
 
364 aa  73.6  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1831  uncharacterized membrane protein  37.23 
 
 
363 aa  71.2  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07331  hypothetical protein  43.33 
 
 
163 aa  71.2  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05561  hypothetical protein  36.17 
 
 
363 aa  68.2  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.620697  normal  0.108587 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05251  hypothetical protein  30.09 
 
 
369 aa  62  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1676  hypothetical protein  34.07 
 
 
353 aa  61.6  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.559181  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0683  hypothetical protein  37.76 
 
 
352 aa  61.6  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.855919 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05551  hypothetical protein  30.09 
 
 
369 aa  60.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0499  hypothetical protein  27.19 
 
 
369 aa  56.6  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45741  predicted protein  36.9 
 
 
777 aa  53.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.931318  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05621  hypothetical protein  25.44 
 
 
368 aa  53.9  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.205307  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_87987  predicted protein  32.98 
 
 
312 aa  48.5  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.250936 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>