18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1676 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1676  hypothetical protein  100 
 
 
353 aa  702    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.559181  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0683  hypothetical protein  54.11 
 
 
352 aa  337  1.9999999999999998e-91  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.855919 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04981  hypothetical protein  37.54 
 
 
364 aa  268  8e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1831  uncharacterized membrane protein  32.96 
 
 
363 aa  202  7e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05561  hypothetical protein  32.69 
 
 
363 aa  189  8e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.620697  normal  0.108587 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05621  hypothetical protein  28.1 
 
 
368 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.205307  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07331  hypothetical protein  54.48 
 
 
163 aa  125  9e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05251  hypothetical protein  24.53 
 
 
369 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05551  hypothetical protein  26.36 
 
 
369 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0499  hypothetical protein  24.8 
 
 
369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4336  hypothetical protein  28.24 
 
 
170 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4399  hypothetical protein  29.91 
 
 
170 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000658631 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1853  hypothetical protein  25.62 
 
 
173 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.540609  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2556  hypothetical protein  28.07 
 
 
183 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1495  hypothetical protein  34.07 
 
 
175 aa  55.1  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0555  hypothetical protein  27.83 
 
 
173 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0628452  normal  0.0529731 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4301  hypothetical protein  25.48 
 
 
178 aa  53.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.159041  normal  0.191419 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3944  hypothetical protein  25.49 
 
 
173 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>