22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3944 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3944  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  354  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1853  hypothetical protein  49.06 
 
 
173 aa  160  6e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.540609  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0555  hypothetical protein  48.73 
 
 
173 aa  157  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0628452  normal  0.0529731 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4399  hypothetical protein  45.51 
 
 
170 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000658631 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2556  hypothetical protein  47.77 
 
 
183 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4336  hypothetical protein  45.51 
 
 
170 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4301  hypothetical protein  42.26 
 
 
178 aa  130  7.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.159041  normal  0.191419 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1495  hypothetical protein  38.65 
 
 
175 aa  101  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04981  hypothetical protein  35.79 
 
 
364 aa  77  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1831  uncharacterized membrane protein  32.67 
 
 
363 aa  75.5  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05561  hypothetical protein  33.66 
 
 
363 aa  75.5  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.620697  normal  0.108587 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0683  hypothetical protein  30.28 
 
 
352 aa  57.4  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.855919 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1313  heat shock protein DnaJ-like  36 
 
 
204 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.94687  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07331  hypothetical protein  35 
 
 
163 aa  55.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05621  hypothetical protein  23.6 
 
 
368 aa  53.9  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.205307  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_87987  predicted protein  29.9 
 
 
312 aa  52.8  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45741  predicted protein  34.18 
 
 
777 aa  49.7  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.931318  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05251  hypothetical protein  22.68 
 
 
369 aa  48.9  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1676  hypothetical protein  24.74 
 
 
353 aa  48.1  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.559181  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05551  hypothetical protein  21.65 
 
 
369 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0499  hypothetical protein  20 
 
 
369 aa  45.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3299  hypothetical protein  36.9 
 
 
724 aa  41.6  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.407297  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>