20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_05561 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_05561  hypothetical protein  100 
 
 
363 aa  729    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.620697  normal  0.108587 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1831  uncharacterized membrane protein  96.14 
 
 
363 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04981  hypothetical protein  40.28 
 
 
364 aa  293  3e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1676  hypothetical protein  31.86 
 
 
353 aa  211  2e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.559181  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0683  hypothetical protein  33.97 
 
 
352 aa  205  9e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.855919 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05251  hypothetical protein  31.65 
 
 
369 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0499  hypothetical protein  31.12 
 
 
369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05621  hypothetical protein  28.27 
 
 
368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.205307  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05551  hypothetical protein  30.85 
 
 
369 aa  129  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07331  hypothetical protein  39.58 
 
 
163 aa  96.3  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3944  hypothetical protein  31.25 
 
 
173 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0555  hypothetical protein  37.11 
 
 
173 aa  73.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0628452  normal  0.0529731 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4336  hypothetical protein  33.67 
 
 
170 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4399  hypothetical protein  33.67 
 
 
170 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000658631 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4301  hypothetical protein  34.38 
 
 
178 aa  67.4  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.159041  normal  0.191419 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1495  hypothetical protein  36.17 
 
 
175 aa  67.8  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2556  hypothetical protein  29.36 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1853  hypothetical protein  31.63 
 
 
173 aa  63.9  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.540609  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_87987  predicted protein  30.71 
 
 
312 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3299  hypothetical protein  32.29 
 
 
724 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.407297  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>