23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1489 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_0722  glucosylceramidase  53.55 
 
 
806 aa  881    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1096  hypothetical protein  54.99 
 
 
804 aa  865    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1489  hypothetical protein  100 
 
 
823 aa  1675    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0920  hypothetical protein  77.82 
 
 
832 aa  1299    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.694299 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0854  hypothetical protein  57.04 
 
 
798 aa  924    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.50872  decreased coverage  0.00887321 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3568  hypothetical protein  51.9 
 
 
816 aa  821    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.592893  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19251  bile acid beta-glucosidase  77.25 
 
 
837 aa  1243    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2263  Glucosylceramidase  53.98 
 
 
805 aa  906    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.492786  hitchhiker  0.0023506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2201  protein of unknown function DUF608  53.86 
 
 
805 aa  906    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0277  protein of unknown function DUF608  52.4 
 
 
801 aa  853    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4519  protein of unknown function DUF608  53.27 
 
 
814 aa  845    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000699051  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1688  hypothetical protein  36.89 
 
 
811 aa  473  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0888837 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0301  hypothetical protein  34.36 
 
 
774 aa  424  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.158573  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4431  hypothetical protein  25.29 
 
 
934 aa  162  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402809  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1712  protein of unknown function DUF608  25.6 
 
 
865 aa  129  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1276  hypothetical protein  23.08 
 
 
688 aa  108  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000117637 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2468  protein of unknown function DUF608  23.68 
 
 
807 aa  103  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.281659  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0489  protein of unknown function DUF608  25.66 
 
 
648 aa  90.5  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.234687  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0211  protein of unknown function DUF608  21.77 
 
 
811 aa  89  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1638  hypothetical protein  25.21 
 
 
661 aa  77.8  0.0000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0737981 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3979  protein of unknown function DUF608  23.45 
 
 
870 aa  77.8  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113578  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6449  protein of unknown function DUF608  21.5 
 
 
857 aa  75.5  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2754  protein of unknown function DUF608  23.24 
 
 
661 aa  72.4  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.127114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>