21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6449 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6449  protein of unknown function DUF608  100 
 
 
857 aa  1794    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2468  protein of unknown function DUF608  40.24 
 
 
807 aa  587  1e-166  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.281659  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0211  protein of unknown function DUF608  39.75 
 
 
811 aa  551  1e-155  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3979  protein of unknown function DUF608  28.7 
 
 
870 aa  337  7.999999999999999e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113578  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1712  protein of unknown function DUF608  29.02 
 
 
865 aa  316  9.999999999999999e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1276  hypothetical protein  22.14 
 
 
688 aa  102  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000117637 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1688  hypothetical protein  22.54 
 
 
811 aa  95.1  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0888837 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2263  Glucosylceramidase  20.53 
 
 
805 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.492786  hitchhiker  0.0023506 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0920  hypothetical protein  22.31 
 
 
832 aa  75.1  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.694299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2201  protein of unknown function DUF608  20.42 
 
 
805 aa  75.1  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0301  hypothetical protein  20.7 
 
 
774 aa  73.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.158573  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0722  glucosylceramidase  20.94 
 
 
806 aa  70.5  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4519  protein of unknown function DUF608  22.43 
 
 
814 aa  68.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000699051  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0277  protein of unknown function DUF608  19.68 
 
 
801 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0489  protein of unknown function DUF608  21.15 
 
 
648 aa  63.5  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.234687  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1489  hypothetical protein  23.42 
 
 
823 aa  62.4  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1638  hypothetical protein  22.29 
 
 
661 aa  62  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0737981 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2754  protein of unknown function DUF608  19.85 
 
 
661 aa  58.5  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.127114  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1096  hypothetical protein  20.53 
 
 
804 aa  57.4  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0854  hypothetical protein  20.9 
 
 
798 aa  54.7  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.50872  decreased coverage  0.00887321 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3568  hypothetical protein  22.05 
 
 
816 aa  45.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.592893  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>