20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1048 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1048  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  540  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0668603  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1452  hypothetical protein  85.66 
 
 
256 aa  442  1e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0618214 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15591  hypothetical protein  71.27 
 
 
269 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.734743 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07531  hypothetical protein  61.48 
 
 
265 aa  350  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.747432  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0114  hypothetical protein  67.51 
 
 
249 aa  350  2e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0945293  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07401  hypothetical protein  65.06 
 
 
250 aa  348  4e-95  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0146348 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07331  hypothetical protein  60.31 
 
 
265 aa  344  7e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07351  hypothetical protein  60.31 
 
 
265 aa  343  2e-93  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1090  hypothetical protein  67.54 
 
 
265 aa  342  2.9999999999999997e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.879899  decreased coverage  0.000000796571 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0680  hypothetical protein  59.14 
 
 
265 aa  339  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07951  hypothetical protein  63.45 
 
 
272 aa  338  5.9999999999999996e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.207074  normal  0.0101021 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1341  hypothetical protein  55.43 
 
 
270 aa  311  9e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000533494 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1313  hypothetical protein  55.43 
 
 
270 aa  310  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0477  hypothetical protein  62.13 
 
 
269 aa  310  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0910  hypothetical protein  55.82 
 
 
277 aa  309  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729442  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3619  hypothetical protein  59.29 
 
 
268 aa  302  3.0000000000000004e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.134368 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0158  hypothetical protein  58.72 
 
 
269 aa  300  2e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4510  hypothetical protein  58.02 
 
 
268 aa  298  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.296514 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43556  predicted protein  38.46 
 
 
249 aa  102  6e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_9675  predicted protein  41.67 
 
 
88 aa  76.3  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.199231 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>