20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1452 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1452  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  519  1e-146  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0618214 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1048  hypothetical protein  85.66 
 
 
269 aa  442  1e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0668603  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15591  hypothetical protein  76.25 
 
 
269 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.734743 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0114  hypothetical protein  69.13 
 
 
249 aa  357  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0945293  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07401  hypothetical protein  66.94 
 
 
250 aa  357  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0146348 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07531  hypothetical protein  64.37 
 
 
265 aa  350  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.747432  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07351  hypothetical protein  61.54 
 
 
265 aa  340  1e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07331  hypothetical protein  61.54 
 
 
265 aa  340  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0680  hypothetical protein  61.13 
 
 
265 aa  338  7e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07951  hypothetical protein  62.5 
 
 
272 aa  337  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.207074  normal  0.0101021 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1090  hypothetical protein  64.63 
 
 
265 aa  335  3.9999999999999995e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.879899  decreased coverage  0.000000796571 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3619  hypothetical protein  56.25 
 
 
268 aa  303  2.0000000000000002e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.134368 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0910  hypothetical protein  58.15 
 
 
277 aa  299  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729442  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1341  hypothetical protein  55.56 
 
 
270 aa  298  5e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000533494 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1313  hypothetical protein  55.56 
 
 
270 aa  298  6e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0477  hypothetical protein  59.32 
 
 
269 aa  296  2e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4510  hypothetical protein  57.08 
 
 
268 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.296514 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0158  hypothetical protein  57.27 
 
 
269 aa  284  9e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43556  predicted protein  39.49 
 
 
249 aa  105  9e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_9675  predicted protein  40.48 
 
 
88 aa  75.9  0.0000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.199231 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>