22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0114 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0114  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0945293  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07401  hypothetical protein  98.8 
 
 
250 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0146348 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1452  hypothetical protein  69.13 
 
 
256 aa  357  9.999999999999999e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0618214 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15591  hypothetical protein  70.69 
 
 
269 aa  352  4e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.734743 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1048  hypothetical protein  67.51 
 
 
269 aa  350  2e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0668603  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07531  hypothetical protein  64.73 
 
 
265 aa  345  5e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.747432  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07331  hypothetical protein  63.22 
 
 
265 aa  339  2e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07351  hypothetical protein  63.22 
 
 
265 aa  338  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0680  hypothetical protein  62.4 
 
 
265 aa  336  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07951  hypothetical protein  61.89 
 
 
272 aa  331  7.000000000000001e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.207074  normal  0.0101021 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1090  hypothetical protein  60.25 
 
 
265 aa  314  7e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.879899  decreased coverage  0.000000796571 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3619  hypothetical protein  61.67 
 
 
268 aa  306  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.134368 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0910  hypothetical protein  58.8 
 
 
277 aa  297  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729442  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0477  hypothetical protein  57.2 
 
 
269 aa  290  2e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0158  hypothetical protein  54.73 
 
 
269 aa  282  5.000000000000001e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1341  hypothetical protein  53.72 
 
 
270 aa  279  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000533494 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1313  hypothetical protein  53.72 
 
 
270 aa  278  5e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4510  hypothetical protein  54.39 
 
 
268 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.296514 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43556  predicted protein  39.1 
 
 
249 aa  112  6e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_9675  predicted protein  42.86 
 
 
88 aa  78.6  0.00000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.199231 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2627  hypothetical protein  29.74 
 
 
288 aa  52.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0664  hypothetical protein  29.49 
 
 
274 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.613077 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>