22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1872 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1872  hypothetical protein  100 
 
 
386 aa  767    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.734  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0781  hypothetical protein  78.16 
 
 
381 aa  580  1e-164  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.354225  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17421  hypothetical protein  67.65 
 
 
388 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09681  hypothetical protein  47.97 
 
 
384 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.200555  hitchhiker  0.00527786 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4381  hypothetical protein  46.34 
 
 
391 aa  346  4e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2400  hypothetical protein  46.53 
 
 
385 aa  331  1e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000734126  hitchhiker  0.00220183 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2511  protein of unknown function DUF129  46.17 
 
 
397 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0201  hypothetical protein  46.32 
 
 
382 aa  321  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.142897  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08331  hypothetical protein  48.31 
 
 
325 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.267137 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08571  hypothetical protein  35.6 
 
 
388 aa  273  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07881  hypothetical protein  36.07 
 
 
388 aa  272  8.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.85732  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08541  hypothetical protein  35.34 
 
 
388 aa  269  5.9999999999999995e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0801  hypothetical protein  36.02 
 
 
389 aa  266  4e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0905  protein of unknown function DUF129  39.81 
 
 
209 aa  146  5e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0992  hypothetical protein  39.11 
 
 
216 aa  142  8e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000209758  normal  0.15397 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0887  hypothetical protein  36.06 
 
 
215 aa  129  8.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000149264  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0487  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.61 
 
 
236 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000293437  normal  0.460106 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1618  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.24 
 
 
920 aa  72.8  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.308528  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5966  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.95 
 
 
893 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111384  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10450  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  31.56 
 
 
938 aa  56.2  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00957139  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19000  hypothetical protein  27.5 
 
 
509 aa  53.9  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.404915  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1632  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.43 
 
 
926 aa  53.5  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.740273 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>