21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4381 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4381  hypothetical protein  100 
 
 
391 aa  798    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2511  protein of unknown function DUF129  59.23 
 
 
397 aa  467  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2400  hypothetical protein  57.4 
 
 
385 aa  465  9.999999999999999e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000734126  hitchhiker  0.00220183 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1872  hypothetical protein  46.34 
 
 
386 aa  346  4e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.734  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17421  hypothetical protein  44.83 
 
 
388 aa  335  5.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0781  hypothetical protein  44.91 
 
 
381 aa  329  6e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.354225  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09681  hypothetical protein  40.54 
 
 
384 aa  289  7e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.200555  hitchhiker  0.00527786 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0201  hypothetical protein  41.06 
 
 
382 aa  249  8e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.142897  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08331  hypothetical protein  41.36 
 
 
325 aa  245  8e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.267137 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08571  hypothetical protein  33.51 
 
 
388 aa  239  8e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07881  hypothetical protein  35.71 
 
 
388 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.85732  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08541  hypothetical protein  33.51 
 
 
388 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0801  hypothetical protein  34.12 
 
 
389 aa  222  7e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0905  protein of unknown function DUF129  43.56 
 
 
209 aa  179  8e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0992  hypothetical protein  41.58 
 
 
216 aa  169  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000209758  normal  0.15397 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0887  hypothetical protein  37.68 
 
 
215 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000149264  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0487  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.48 
 
 
236 aa  117  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000293437  normal  0.460106 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1618  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.06 
 
 
920 aa  84  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.308528  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5966  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.69 
 
 
893 aa  67  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111384  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1632  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.69 
 
 
926 aa  60.5  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.740273 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10450  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  26.92 
 
 
938 aa  45.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00957139  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>