18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0404 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0404  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  390  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0270  hypothetical protein  67.86 
 
 
211 aa  263  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0315  hypothetical protein  65.05 
 
 
206 aa  259  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0405  hypothetical protein  62.5 
 
 
208 aa  238  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4189  hypothetical protein  64.21 
 
 
208 aa  237  6.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0757327  normal  0.729118 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3459  hypothetical protein  36.5 
 
 
179 aa  111  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3635  hypothetical protein  36.5 
 
 
179 aa  110  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4231  outer membrane protein H1  31.5 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.91755  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1197  outer membrane protein H1  31 
 
 
201 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.397071  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1185  outer membrane protein H1  30.5 
 
 
201 aa  72  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.247774  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1215  outer membrane protein H1  30.5 
 
 
201 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558804  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4241  outer membrane protein H1  31.09 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.186176  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2977  hypothetical protein  29.95 
 
 
201 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.128121 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1120  outer membrane insertion C-terminal signal  30.14 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000147263  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0560  outer membrane insertion C-terminal signal  28.37 
 
 
206 aa  59.3  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.439899  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4201  outer membrane protein H1 precursor  28.35 
 
 
200 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49200  PhoP/Q and low Mg2+ inducible outer membrane prote  28.35 
 
 
200 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00152056 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1443  hypothetical protein  27.32 
 
 
195 aa  47.8  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0375873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>