19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0270 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0270  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  436  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0315  hypothetical protein  61.65 
 
 		 206 aa  266  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0405  hypothetical protein  63.46 
 
 		 208 aa  251  7e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4189  hypothetical protein  65.79 
 
 		 208 aa  249  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0757327  normal  0.729118 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0404  hypothetical protein  67.86 
 
 		 191 aa  246  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3459  hypothetical protein  36.18 
 
 		 179 aa  95.5  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3635  hypothetical protein  36.18 
 
 		 179 aa  95.1  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4201  outer membrane protein H1 precursor  29.35 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2977  hypothetical protein  31.44 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.128121 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4241  outer membrane protein H1  32.88 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.186176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0560  outer membrane insertion C-terminal signal  27.62 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.439899  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49200  PhoP/Q and low Mg2+ inducible outer membrane prote  28.86 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152056 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1185  outer membrane protein H1  30.3 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.247774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1215  outer membrane protein H1  30.3 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1197  outer membrane protein H1  30.3 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.397071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4231  outer membrane protein H1  29.55 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.91755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1120  outer membrane insertion C-terminal signal  27.62 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000147263  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1443  hypothetical protein  28.49 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0375873  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1027  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.26 
 
 		 437 aa  41.6  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.313073  normal  0.124762 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>