More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2371 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2371  hypothetical protein  100 
 
 
710 aa  1432    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000745259  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2994  cell division protein  38.78 
 
 
704 aa  474  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0805181  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14400  cell division protein FtsA  38.72 
 
 
732 aa  444  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.713255  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1238  cell division protein FtsA  39.36 
 
 
647 aa  435  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1886  cell division protein FtsA  36.43 
 
 
708 aa  413  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.57751  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0027  cell division protein FtsA  36.67 
 
 
690 aa  399  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1036  cell division protein FtsA  41.94 
 
 
584 aa  395  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0298  cell division protein FtsA  34.22 
 
 
698 aa  379  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1368  HSP70 family ATPase  34.79 
 
 
617 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274966  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0998  cell division protein FtsA  34.66 
 
 
695 aa  355  1e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1494  cell division protein FtsA  34.05 
 
 
664 aa  340  5.9999999999999996e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1542  cell division protein FtsA  34.05 
 
 
664 aa  339  8e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1810  cell division actin-like ATPase  33.89 
 
 
661 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.37733  normal  0.755653 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2801  cell division protein FtsA  31.83 
 
 
703 aa  323  5e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1919  cell division protein FtsA  33.8 
 
 
695 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0693277  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2641  cell division protein FtsA  25.74 
 
 
420 aa  97.1  9e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0272367  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3452  cell division protein FtsA  24.06 
 
 
413 aa  92.4  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.131798 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4530  cell division protein FtsA  24.27 
 
 
411 aa  91.7  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000264478  hitchhiker  0.000036158 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3808  cell division protein FtsA  24.46 
 
 
411 aa  91.3  6e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000197633  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0357  cell division protein FtsA  25.24 
 
 
411 aa  90.1  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000963388  hitchhiker  0.000721309 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3450  cell division protein FtsA  23.79 
 
 
411 aa  89.4  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000166188  hitchhiker  0.000034496 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0413  cell division protein FtsA  23.06 
 
 
411 aa  89.7  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00909742  hitchhiker  0.00170264 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4669  cell division protein FtsA  25.92 
 
 
419 aa  89  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000165844  normal  0.464968 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1976  cell division protein FtsA  25.86 
 
 
420 aa  88.6  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000208947  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2264  cell division protein FtsA  24.04 
 
 
412 aa  87.8  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0392802  hitchhiker  0.00222131 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0587  cell division protein FtsA  26.61 
 
 
417 aa  87.4  8e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000283199  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4098  cell division protein FtsA  26.49 
 
 
418 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.14475  normal  0.627944 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0404  cell division protein FtsA  25.15 
 
 
411 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000380167  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4404  cell division protein FtsA  26.49 
 
 
418 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0640092  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0665  cell division protein FtsA  27.54 
 
 
411 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000156077  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0926  cell division protein FtsA  26.68 
 
 
415 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0559098  normal  0.998938 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0416  cell division protein FtsA  25.15 
 
 
411 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000530477  unclonable  0.0000068927 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0358  cell division protein FtsA  24.33 
 
 
411 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000107954  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0430  cell division protein FtsA  25.15 
 
 
411 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000124694  hitchhiker  0.0000000000723635 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3801  cell division protein FtsA  24.2 
 
 
411 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000784597  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57290  cell division protein FtsA  25.43 
 
 
417 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4980  cell division protein FtsA  25.43 
 
 
417 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248977  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0405  cell division protein FtsA  25.15 
 
 
411 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000457966  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4216  cell division protein FtsA  25.15 
 
 
411 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0490  cell division protein FtsA  25.15 
 
 
411 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000456423  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0380  cell division protein FtsA  24.75 
 
 
422 aa  85.5  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00706299  normal  0.0389324 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2186  cell division protein FtsA  25.37 
 
 
423 aa  85.5  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0110179  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3567  cell division protein FtsA  25.15 
 
 
411 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000490068  decreased coverage  0.000000000512084 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0389  cell division protein FtsA  25.15 
 
 
411 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000990996  hitchhiker  0.000418881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0201  cell division protein FtsA  24.75 
 
 
422 aa  85.5  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.449643  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3740  cell division protein FtsA  25.15 
 
 
411 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000982016  hitchhiker  0.0000000353047 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0948  cell division protein FtsA  25.69 
 
 
418 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.249697  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004487  cell division protein FtsA  25.5 
 
 
420 aa  84.7  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000664411  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00095  cell division protein  24.01 
 
 
420 aa  84.3  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000325229  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3506  cell division protein FtsA  24.01 
 
 
420 aa  84.3  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000162292  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1341  cell division protein FtsA  25.81 
 
 
443 aa  84.7  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.722513  normal  0.0156243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4508  cell division protein FtsA  25.81 
 
 
420 aa  84.7  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00626998  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0099  cell division protein FtsA  24.01 
 
 
420 aa  84.3  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000243315  normal  0.662552 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00094  hypothetical protein  24.01 
 
 
420 aa  84.3  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000213686  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0087  cell division protein FtsA  24.01 
 
 
420 aa  84.3  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000920666  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3563  cell division protein FtsA  24.01 
 
 
420 aa  84.3  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000026867  normal  0.0140898 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0100  cell division protein FtsA  24.01 
 
 
420 aa  84.3  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  2.5263e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00905  cell division protein FtsA  25.19 
 
 
420 aa  84.7  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0096  cell division protein FtsA  24.01 
 
 
420 aa  84.3  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000450452  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0102  cell division protein FtsA  24.01 
 
 
420 aa  84.3  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000385207  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4383  cell division protein FtsA  25.81 
 
 
420 aa  84.3  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000385058  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13290  cell division protein FtsA  26.34 
 
 
415 aa  84  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00675344  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3494  cell division protein FtsA  24.11 
 
 
409 aa  83.6  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0808464  normal  0.335158 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0774  cell division protein FtsA  28.26 
 
 
412 aa  82.8  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.125422  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0416  cell division protein FtsA  26.16 
 
 
411 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.840628  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0876  cell division protein FtsA  23.28 
 
 
461 aa  83.2  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000980071  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0637  cell division protein FtsA  23.1 
 
 
400 aa  82.4  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000369276  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0513  cell division protein FtsA  24.19 
 
 
411 aa  82  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0496  cell division protein FtsA  24.26 
 
 
411 aa  82.4  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00048929  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0454  cell division protein FtsA  24 
 
 
416 aa  82  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0012381  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3064  cell division protein FtsA  25.3 
 
 
411 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2489  cell division protein FtsA  27.37 
 
 
412 aa  81.3  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.391008  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2840  cell division protein FtsA  24.06 
 
 
410 aa  81.3  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2188  cell division protein FtsA  24.81 
 
 
412 aa  80.9  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.083381  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0444  cell division protein FtsA  23.29 
 
 
413 aa  80.9  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000368895  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2720  cell division protein FtsA  24.24 
 
 
410 aa  80.1  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.705635  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3503  cell division protein FtsA  25.06 
 
 
415 aa  80.5  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000300087  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2424  cell division protein FtsA  27.05 
 
 
411 aa  80.1  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0673361  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2975  cell division protein FtsA  24.46 
 
 
410 aa  80.5  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.254584  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2669  cell division protein FtsA  24.46 
 
 
410 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00924647  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1668  cell division protein FtsA  24.31 
 
 
413 aa  80.5  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06505  Cell division protein FtsA  24.69 
 
 
445 aa  80.1  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3124  cell division protein FtsA  24.46 
 
 
410 aa  80.1  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.59264  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3085  cell division protein FtsA  24.24 
 
 
410 aa  80.1  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0526  cell division protein FtsA  24.55 
 
 
408 aa  79.7  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3777  cell division protein FtsA  24.33 
 
 
410 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.11031  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3833  cell division protein FtsA  24.33 
 
 
410 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3515  cell division protein FtsA  24.69 
 
 
409 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000329989  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0640  cell division protein FtsA  23.76 
 
 
418 aa  79.3  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000505976  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3917  cell division protein FtsA  24.33 
 
 
410 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2448  cell division protein FtsA  23.81 
 
 
411 aa  79.7  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00757496  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0765  cell division protein FtsA  23.76 
 
 
418 aa  79  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000001661  normal  0.370373 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0149  cell division protein FtsA  23.76 
 
 
420 aa  79  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000205082  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0141  cell division protein FtsA  23.76 
 
 
420 aa  79  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.0011437  normal  0.628842 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3969  cell division protein FtsA  23.76 
 
 
411 aa  79  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000373054  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0849  cell division protein FtsA  23.66 
 
 
410 aa  79  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000717091  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0144  cell division protein FtsA  23.76 
 
 
420 aa  79  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0165123  hitchhiker  0.00000137113 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0144  cell division protein FtsA  23.76 
 
 
420 aa  79  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000104465  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0148  cell division protein FtsA  23.76 
 
 
420 aa  79  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000465462  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0832  cell division protein FtsA  23.41 
 
 
410 aa  78.6  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000238279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>