15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1503 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1503  YvyF  100 
 
 
75 aa  154  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17170  flagellar protein  37.14 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2239  flagellar protein  32.88 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0532925 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0448  hypothetical protein  32.39 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0189  flagellar protein  43.06 
 
 
139 aa  54.3  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.445463  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3231  hypothetical protein  35.14 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1678  hypothetical protein  31.43 
 
 
146 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2681  hypothetical protein  38.57 
 
 
118 aa  50.1  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0141834  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2247  regulatory protein, MerR  30.56 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.032489  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0091  regulatory protein, MerR  30.56 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0249  hypothetical protein  29.58 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00142663  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3034  flagellar protein  32.89 
 
 
135 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2567  hypothetical protein  28.57 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3346  regulatory protein, MerR  30.56 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.144933  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0287  hypothetical protein  30.67 
 
 
124 aa  42  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>