14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3346 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3346  regulatory protein, MerR  100 
 
 		 77 aa  156  7e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.144933  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2247  regulatory protein, MerR  44 
 
 		 147 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.032489  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0091  regulatory protein, MerR  37.33 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2239  flagellar protein  37.5 
 
 		 138 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0532925 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1678  hypothetical protein  33.8 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0249  hypothetical protein  27.94 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00142663  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17170  flagellar protein  32.35 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1332  regulatory protein, MerR  34.78 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000117458  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3231  hypothetical protein  31.17 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0883  flagellar protein  36.84 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00624753  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0448  hypothetical protein  30 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1503  YvyF  30.56 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2567  hypothetical protein  28.79 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0189  flagellar protein  26.03 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.445463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>