15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2247 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2247  regulatory protein, MerR  100 
 
 		 147 aa  301  2.0000000000000002e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.032489  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0091  regulatory protein, MerR  54.68 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1678  hypothetical protein  47.48 
 
 		 146 aa  133  8e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0448  hypothetical protein  43.17 
 
 		 138 aa  114  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0883  flagellar protein  40.44 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00624753  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0249  hypothetical protein  44.76 
 
 		 133 aa  100  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00142663  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17170  flagellar protein  42.06 
 
 		 144 aa  100  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2567  hypothetical protein  36.15 
 
 		 142 aa  98.2  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2239  flagellar protein  37.04 
 
 		 138 aa  97.8  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0532925 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0189  flagellar protein  40.34 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.445463  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3346  regulatory protein, MerR  44 
 
 		 77 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.144933  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3231  hypothetical protein  33.04 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3034  flagellar protein  32.48 
 
 		 135 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1332  regulatory protein, MerR  34.25 
 
 		 83 aa  60.1  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000117458  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1503  YvyF  30.56 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>