18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0249 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0249  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  278  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00142663  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0091  regulatory protein, MerR  37.12 
 
 
137 aa  101  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2247  regulatory protein, MerR  44.76 
 
 
147 aa  100  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.032489  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1678  hypothetical protein  43.86 
 
 
146 aa  98.6  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0448  hypothetical protein  35.77 
 
 
138 aa  95.1  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17170  flagellar protein  42.59 
 
 
144 aa  89  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2567  hypothetical protein  36.54 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2239  flagellar protein  35.29 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0532925 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0883  flagellar protein  32.06 
 
 
139 aa  77  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00624753  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3231  hypothetical protein  32.28 
 
 
136 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0189  flagellar protein  31.85 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.445463  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3034  flagellar protein  31.48 
 
 
135 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0287  hypothetical protein  35.62 
 
 
124 aa  51.2  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3346  regulatory protein, MerR  27.94 
 
 
77 aa  50.4  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.144933  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1503  YvyF  29.58 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2681  hypothetical protein  31.08 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0141834  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1332  regulatory protein, MerR  29.33 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000117458  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0662  hypothetical protein  27.36 
 
 
119 aa  41.2  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>