15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4443 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4443  hypothetical protein  100 
 
 		 672 aa  1367    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2303  hypothetical protein  34 
 
 		 709 aa  349  8e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.344884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0907  hypothetical protein  36.39 
 
 		 673 aa  323  6e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0310  hypothetical protein  25.58 
 
 		 727 aa  121  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0639  portal protein  23.66 
 
 		 725 aa  104  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.308579 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0401  portal protein  22.43 
 
 		 725 aa  94.7  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000565323 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3003  hypothetical protein  24.29 
 
 		 690 aa  89.7  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5695  hypothetical protein  24.01 
 
 		 651 aa  87.4  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00826  hypothetical genomic island protein  22.45 
 
 		 700 aa  81.6  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2355  hypothetical protein  28.89 
 
 		 779 aa  74.3  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.512259  unclonable  0.0000000418473 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3058  hypothetical protein  22.65 
 
 		 734 aa  71.2  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0500224  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0228  hypothetical protein  21.81 
 
 		 628 aa  69.7  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0386  hypothetical protein  24.29 
 
 		 576 aa  54.3  0.000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1145  hypothetical protein  23.66 
 
 		 612 aa  53.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.983998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3865  hypothetical protein  29.84 
 
 		 261 aa  47.8  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>