17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4062 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4062  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  100 
 
 		 391 aa  785    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4748  hypothetical protein  40.36 
 
 		 404 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.407896  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0505  hypothetical protein  92 
 
 		 128 aa  231  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2630  hypothetical protein  37.89 
 
 		 378 aa  229  6e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0276394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1268  hypothetical protein  38.14 
 
 		 378 aa  227  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1035  hypothetical protein  37.29 
 
 		 386 aa  227  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3768  hypothetical protein  37.98 
 
 		 368 aa  208  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.979798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7694  hypothetical protein  40.15 
 
 		 286 aa  180  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5592  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  36.19 
 
 		 296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2563  protein pyrophosphatase  38.76 
 
 		 306 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21767  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0390  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  38.2 
 
 		 112 aa  51.6  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0788  gene 37 protein (Gp37)  37.88 
 
 		 109 aa  48.9  0.0002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.452336  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09681  pyrophosphatase  30.56 
 
 		 109 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0888899  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08481  pyrophosphatase  39.39 
 
 		 109 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.477577  hitchhiker  0.00393115 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09501  pyrophosphatase  32.94 
 
 		 109 aa  43.5  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.798581  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1064  hypothetical protein  39.39 
 
 		 109 aa  43.1  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0099  hypothetical protein  39.39 
 
 		 109 aa  42.7  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>