22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1035 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1035  hypothetical protein  100 
 
 
386 aa  803    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2630  hypothetical protein  64.34 
 
 
378 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0276394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1268  hypothetical protein  64.34 
 
 
378 aa  514  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3768  hypothetical protein  62.36 
 
 
368 aa  493  9.999999999999999e-139  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.979798  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4062  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  37.29 
 
 
391 aa  227  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4748  hypothetical protein  33.41 
 
 
404 aa  212  9e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.407896  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5592  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  42.79 
 
 
296 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7694  hypothetical protein  40.95 
 
 
286 aa  172  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2563  protein pyrophosphatase  37.44 
 
 
306 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21767  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0505  hypothetical protein  49.09 
 
 
128 aa  59.3  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09481  pyrophosphatase  38.27 
 
 
109 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.615741  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0889  hypothetical protein  37.04 
 
 
109 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09681  pyrophosphatase  33.72 
 
 
109 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0888899  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09941  pyrophosphatase  38.24 
 
 
109 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0296  MazG family pyrophosphatase  33.72 
 
 
109 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08481  pyrophosphatase  37.65 
 
 
109 aa  50.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.477577  hitchhiker  0.00393115 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1064  hypothetical protein  36.47 
 
 
109 aa  50.1  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15421  pyrophosphatase  37.21 
 
 
109 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.371256 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09501  pyrophosphatase  37.04 
 
 
109 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.798581  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1435  hypothetical protein  33.64 
 
 
109 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533178  normal  0.113452 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2015  hypothetical protein  39.24 
 
 
115 aa  45.8  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0390  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  34.12 
 
 
112 aa  44.3  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>