16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1268 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2630  hypothetical protein  92.06 
 
 
378 aa  724    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0276394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1268  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  773    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3768  hypothetical protein  66.85 
 
 
368 aa  519  1e-146  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.979798  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1035  hypothetical protein  64.34 
 
 
386 aa  514  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4062  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  38.14 
 
 
391 aa  227  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4748  hypothetical protein  38.34 
 
 
404 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.407896  normal  0.100227 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5592  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  43.93 
 
 
296 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7694  hypothetical protein  39.91 
 
 
286 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270942  normal  0.445341 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2563  protein pyrophosphatase  38.12 
 
 
306 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.21767  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0505  hypothetical protein  46.38 
 
 
128 aa  67  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09501  pyrophosphatase  41.18 
 
 
109 aa  53.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.798581  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09481  pyrophosphatase  41.18 
 
 
109 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.615741  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0889  hypothetical protein  39.71 
 
 
109 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09941  pyrophosphatase  38.24 
 
 
109 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2015  hypothetical protein  35.37 
 
 
115 aa  44.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0390  MazG nucleotide pyrophosphohydrolase  42.62 
 
 
112 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>