33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2938 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2938  phage shock B family protein  100 
 
 		 89 aa  179  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.934534  normal  0.0359488 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0208  phage shock B  48.35 
 
 		 91 aa  90.5  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.50691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1157  hypothetical protein  42.7 
 
 		 98 aa  81.6  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.525523  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02832  phage shock protein B  41.43 
 
 		 79 aa  60.5  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1282  phage shock protein B  46.38 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0482  phage shock protein B  40.91 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1217  phage shock protein B  39.19 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0496773  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3771  phage shock protein B  33.78 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.896291  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2479  phage shock protein B  34.25 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003813  phage shock protein B  37.5 
 
 		 77 aa  53.5  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1238  phage shock protein B  32.88 
 
 		 79 aa  53.5  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0677488 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3099  phage shock protein B  34.72 
 
 		 75 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.555844  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2668  phage shock protein B  34.72 
 
 		 75 aa  52.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01873  phage shock protein B  37.5 
 
 		 77 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1555  phage shock protein B  33.33 
 
 		 77 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000980293 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1808  phage shock protein B  32.88 
 
 		 79 aa  51.6  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2647  phage shock protein B  32.88 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.477944 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2481  phage shock protein B  32.88 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00810138 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2549  phage shock protein B  32.88 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.938994  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2495  phage shock protein B  34.72 
 
 		 79 aa  51.2  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0474104  normal  0.0755646 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1607  phage shock protein B  31.51 
 
 		 77 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1641  phage shock protein B  31.51 
 
 		 77 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.543996  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1618  phage shock protein B  31.51 
 
 		 77 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2736  phage shock protein B  31.51 
 
 		 79 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.121185  normal  0.12779 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2577  phage shock protein B  30.14 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.982322  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1503  phage shock protein B  31.51 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3003  phage shock protein B  38.18 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0407  phage shock protein B  36.11 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1787  phage shock protein B  34.33 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2623  phage shock protein B  31.34 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.105345  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2536  phage shock protein B  34.33 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1895  phage shock protein B  34.33 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1617  phage shock protein B  26.56 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00230478  normal  0.227961 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>