51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2495 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2495  phage shock protein B  100 
 
 		 79 aa  159  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0474104  normal  0.0755646 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1808  phage shock protein B  80.77 
 
 		 79 aa  138  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2736  phage shock protein B  79.75 
 
 		 79 aa  138  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.121185  normal  0.12779 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2668  phage shock protein B  84 
 
 		 75 aa  138  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3099  phage shock protein B  84 
 
 		 75 aa  135  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.555844  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1555  phage shock protein B  79.22 
 
 		 77 aa  135  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000980293 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1607  phage shock protein B  79.22 
 
 		 77 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1641  phage shock protein B  79.22 
 
 		 77 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.543996  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1618  phage shock protein B  79.22 
 
 		 77 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2481  phage shock protein B  80.26 
 
 		 77 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00810138 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2549  phage shock protein B  80.26 
 
 		 77 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.938994  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2647  phage shock protein B  80.26 
 
 		 77 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.477944 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2479  phage shock protein B  74.68 
 
 		 79 aa  133  9e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1503  phage shock protein B  79.22 
 
 		 77 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1238  phage shock protein B  76.92 
 
 		 79 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0677488 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2577  phage shock protein B  77.92 
 
 		 77 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.982322  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3771  phage shock protein B  66.67 
 
 		 75 aa  109  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.896291  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02832  phage shock protein B  66.2 
 
 		 79 aa  108  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3003  phage shock protein B  73.02 
 
 		 78 aa  103  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1282  phage shock protein B  53.42 
 
 		 77 aa  89  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0407  phage shock protein B  55.56 
 
 		 82 aa  87.8  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0482  phage shock protein B  53.73 
 
 		 74 aa  87  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01873  phage shock protein B  46.67 
 
 		 77 aa  82  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1617  phage shock protein B  45.21 
 
 		 73 aa  81.3  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00230478  normal  0.227961 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003813  phage shock protein B  44 
 
 		 77 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2168  phage shock protein B  48.57 
 
 		 74 aa  67  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2623  phage shock protein B  45.21 
 
 		 75 aa  66.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.105345  normal  0.424445 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1541  phage shock protein B  44 
 
 		 74 aa  65.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1947  phage shock protein B  44 
 
 		 74 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2341  phage shock protein B  44 
 
 		 74 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00105318  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01293  hypothetical protein  44 
 
 		 74 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1817  phage shock protein B  44 
 
 		 74 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.233686 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1895  phage shock protein B  42.47 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01282  phage shock protein B  44 
 
 		 74 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1787  phage shock protein B  42.47 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1420  phage shock protein B  44 
 
 		 74 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2536  phage shock protein B  42.47 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2320  phage shock protein B  44 
 
 		 74 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.090335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1515  phage shock protein B  45.07 
 
 		 74 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2334  phage shock protein B  46.38 
 
 		 74 aa  64.3  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.825247  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1723  phage shock protein B  41.67 
 
 		 76 aa  62.4  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2103  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2609  phage shock protein B  45.71 
 
 		 74 aa  62.4  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00720004  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1813  phage shock protein B  45.07 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000257834 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1875  phage shock protein B  45.07 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0101058 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1814  phage shock protein B  45.07 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.188952 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1461  phage shock protein B  45.07 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.680677  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1643  phage shock protein B  45.07 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000521848 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1755  phage shock protein B  43.06 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1217  phage shock protein B  41.25 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0496773  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2938  phage shock B family protein  34.72 
 
 		 89 aa  51.2  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.934534  normal  0.0359488 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0208  phage shock B  34.29 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.50691  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>