15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2052 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2052  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  356  9e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.602887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2051  hypothetical protein  30.5 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2043  hypothetical protein  26.85 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.424976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10139  hypothetical protein  28.03 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4181  hypothetical protein  26.77 
 
 		 199 aa  54.3  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.792134  normal  0.654324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5469  hypothetical protein  29.55 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3917  hypothetical protein  35.14 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5090  hypothetical protein  28.03 
 
 		 190 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5178  hypothetical protein  28.03 
 
 		 190 aa  50.8  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1107  hypothetical protein  28.3 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3730  hypothetical protein  27.89 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2054  hypothetical protein  28.19 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0592172  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0111  hypothetical protein  28.81 
 
 		 200 aa  45.8  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.452646  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5706  hypothetical protein  27.36 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0513889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0421  protein of unknown function DUF1486  31.36 
 
 		 166 aa  40.8  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.378501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>